More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1854 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  55.69 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
247 aa  249  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  50.41 
 
 
249 aa  246  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  54.13 
 
 
254 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  48.36 
 
 
266 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.77 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  43.51 
 
 
243 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  46.31 
 
 
271 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  48.76 
 
 
261 aa  219  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
254 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  46.72 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  47.54 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
265 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  46.91 
 
 
258 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  48.59 
 
 
261 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.49 
 
 
271 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  44.9 
 
 
245 aa  214  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  45.87 
 
 
261 aa  214  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  46.12 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  43.27 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  44.08 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.19 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  44.96 
 
 
248 aa  211  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  46.28 
 
 
257 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  44.67 
 
 
294 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  48.35 
 
 
252 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  47.92 
 
 
266 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  49.79 
 
 
249 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  44.9 
 
 
247 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
258 aa  208  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
278 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  44.4 
 
 
257 aa  208  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
250 aa  208  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  43.44 
 
 
245 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  46.25 
 
 
246 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  43.9 
 
 
254 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  44.39 
 
 
240 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  44.81 
 
 
313 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  47.54 
 
 
273 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0775  ABC transporter  49.59 
 
 
258 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0591265 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  45.98 
 
 
263 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  44.21 
 
 
264 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  46.88 
 
 
262 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  45.68 
 
 
276 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.36 
 
 
260 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.44 
 
 
269 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  42.74 
 
 
260 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  43.72 
 
 
253 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  46.51 
 
 
504 aa  201  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  46.34 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  45.14 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  42.23 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  43.07 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  42.68 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  42.86 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 
265 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.53 
 
 
265 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  42.68 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  44.03 
 
 
247 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  44.26 
 
 
266 aa  198  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
283 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  46.31 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  45.91 
 
 
509 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
288 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  43.2 
 
 
278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  43.85 
 
 
246 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  43.1 
 
 
258 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  40 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  47.52 
 
 
261 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  44.63 
 
 
265 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
269 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.72 
 
 
255 aa  194  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  42.8 
 
 
266 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.28 
 
 
271 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  47.56 
 
 
256 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  42.21 
 
 
256 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.92 
 
 
501 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.5 
 
 
273 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  41.42 
 
 
260 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  45.76 
 
 
256 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  45.16 
 
 
257 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  45.71 
 
 
260 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  43.24 
 
 
262 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  44.27 
 
 
265 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4541  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.39 
 
 
501 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  43.25 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  48.99 
 
 
272 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.72 
 
 
273 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.46 
 
 
286 aa  188  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  44.35 
 
 
280 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  43.67 
 
 
259 aa  188  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
259 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  41.87 
 
 
501 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  41.87 
 
 
254 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  44.26 
 
 
271 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
260 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>