More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3847 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  96.68 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  84.4 
 
 		 254 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  81.64 
 
 		 257 aa  417  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  78.08 
 
 		 266 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  71.65 
 
 		 269 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  75.2 
 
 		 264 aa  381  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  75.2 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  73.83 
 
 		 261 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  75.61 
 
 		 257 aa  377  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  74 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  73.23 
 
 		 261 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  73.28 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  73.98 
 
 		 275 aa  363  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  66.67 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  63.98 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  56.91 
 
 		 263 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  57.74 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  52.22 
 
 		 278 aa  258  9e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  58.09 
 
 		 265 aa  255  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  58.47 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  54.32 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  54.98 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  55.6 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  52.82 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  52.24 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  48.36 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  53.44 
 
 		 262 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  57.68 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  50.61 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  49.58 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  52.28 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.3 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  55.3 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  48.69 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  51.42 
 
 		 276 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  55 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  50.4 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.25 
 
 		 286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  48.36 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  51.05 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  46.31 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  50.6 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  46.31 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  50 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  47.76 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  47.18 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  47.6 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  47.62 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  45.02 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  45.49 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.84 
 
 		 268 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  49.18 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  45.34 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  48.73 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  45.45 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  44.08 
 
 		 271 aa  211  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  45.04 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  45.12 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  44.71 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  50 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  44.84 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  45.04 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  46.34 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  46.67 
 
 		 247 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  44.76 
 
 		 265 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.9 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  45.83 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  45.9 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  48.37 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.37 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  44.05 
 
 		 260 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  48.19 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  44.26 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  46.67 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  44.49 
 
 		 260 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  46.99 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  43.95 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  44.67 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.22 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  40.32 
 
 		 294 aa  201  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  44.21 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  44.22 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.55 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.42 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  46.09 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  43.03 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  47.15 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  45.9 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  46.56 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>