More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3688 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 261 aa  524  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  99.23 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  80.91 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  78.66 
 
 		 273 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  63.03 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  59 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0775  ABC transporter  59.75 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0591265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  48.18 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  48.37 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  47.03 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  51.33 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  45.64 
 
 		 247 aa  225  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  48.37 
 
 		 271 aa  224  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  47.54 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  46.12 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  46.99 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  49.38 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  45.12 
 
 		 263 aa  218  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  48.95 
 
 		 261 aa  218  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  46.31 
 
 		 259 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  47.33 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  44.35 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  45.45 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  45.87 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  47.15 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  45.9 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  45.49 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.67 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  46.12 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  47.92 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  45.53 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  46.91 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  47.11 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.57 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  46.59 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  45.15 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 		 275 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  47.08 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  42.64 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  44.94 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  45.75 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  44.81 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  45.68 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  48.55 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  45.42 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.44 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  44.67 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.4 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  44.49 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  46.09 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.57 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  47.14 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  43.88 
 
 		 263 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  41.67 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.87 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  44.53 
 
 		 265 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  41.84 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  45.56 
 
 		 259 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 535 aa  198  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.25 
 
 		 495 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  42.5 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  42.26 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  44.26 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.88 
 
 		 514 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.88 
 
 		 514 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  40.5 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  43.57 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  44.44 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.88 
 
 		 514 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  44.35 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.98 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  46.75 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  46.67 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  41.98 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  44.03 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  42.97 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>