More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0345 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  60.56 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  58.96 
 
 		 258 aa  298  8e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  58.89 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  49.41 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  50.2 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  49.62 
 
 		 274 aa  251  8.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  47.51 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  51.22 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  51.23 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  50.62 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  47.6 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  51.43 
 
 		 265 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  52 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  52.19 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  49.22 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  50.4 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.61 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  48.63 
 
 		 259 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  48.78 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  48.77 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  48.39 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  49.39 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  45.91 
 
 		 257 aa  234  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  50.81 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  46.46 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  50.2 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  46.46 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  46.67 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  49.81 
 
 		 265 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 278 aa  230  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  49.2 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  47.77 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  47.39 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  48.8 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  48.97 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  50 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.43 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  47.58 
 
 		 262 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.83 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  50.41 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  47.97 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  46.75 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  49.39 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  46.28 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  48.98 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  48.98 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  46.34 
 
 		 245 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  50.61 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  51.42 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  48.19 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  50 
 
 		 254 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  47.97 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  45.42 
 
 		 259 aa  222  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.64 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  48.41 
 
 		 271 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  48.57 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  45.75 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  50.41 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  48.56 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  46.09 
 
 		 249 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  48.02 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 276 aa  218  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  44.76 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  49.01 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  46.34 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  48.57 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  47.62 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  48.18 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  47.83 
 
 		 276 aa  215  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  44.22 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  49.38 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  43.9 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 		 288 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  46.43 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  45.35 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  44.13 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  45.27 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  43.48 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  48.58 
 
 		 272 aa  208  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  45.78 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  44.58 
 
 		 260 aa  208  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  43.6 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  43.08 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.04 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  43.32 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  43.9 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.09 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  42.92 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.22 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>