More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3112 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  83.59 
 
 
261 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  83.14 
 
 
261 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  82.56 
 
 
260 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  82.56 
 
 
260 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  71.54 
 
 
260 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  71.95 
 
 
260 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  72.76 
 
 
260 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  68.72 
 
 
248 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  69.96 
 
 
263 aa  343  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  65.46 
 
 
258 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  65.32 
 
 
257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  65.16 
 
 
258 aa  323  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  50.21 
 
 
249 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  44.71 
 
 
257 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  43.31 
 
 
263 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 
275 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  46.31 
 
 
271 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  46.5 
 
 
261 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  47.46 
 
 
261 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  46.91 
 
 
244 aa  221  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  46.31 
 
 
271 aa  221  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  46.86 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
260 aa  218  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  45.6 
 
 
252 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  42.68 
 
 
260 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  41.8 
 
 
313 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 
271 aa  215  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  47.08 
 
 
264 aa  215  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  45.19 
 
 
265 aa  214  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  44.63 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  44.21 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  45.8 
 
 
265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  46.61 
 
 
273 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.35 
 
 
277 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
247 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  43.62 
 
 
254 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  45.7 
 
 
273 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
278 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  41.22 
 
 
261 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 
510 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  45.58 
 
 
261 aa  206  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  44.4 
 
 
257 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.46 
 
 
245 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  42.5 
 
 
271 aa  205  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  42.98 
 
 
502 aa  205  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  42.92 
 
 
271 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  45.62 
 
 
276 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
269 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  44.03 
 
 
253 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
265 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  40.62 
 
 
258 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  44.4 
 
 
517 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  43.27 
 
 
517 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  43.27 
 
 
517 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  42.86 
 
 
265 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 
288 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  43.27 
 
 
517 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  43.27 
 
 
517 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 
517 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  44.54 
 
 
246 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  42.32 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  42.86 
 
 
517 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  42.86 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  44.77 
 
 
518 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  44.63 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.53 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  43.08 
 
 
260 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41 
 
 
496 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  44.26 
 
 
257 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  44.12 
 
 
247 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  42.97 
 
 
294 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.46 
 
 
507 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
507 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.46 
 
 
507 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.74 
 
 
260 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
517 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  41.74 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.44 
 
 
506 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  41.95 
 
 
262 aa  194  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
276 aa  194  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  47.47 
 
 
254 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.84 
 
 
286 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
506 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.17 
 
 
499 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  41.98 
 
 
250 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  41.6 
 
 
506 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  42.51 
 
 
263 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  44.12 
 
 
519 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  39.92 
 
 
508 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  42.35 
 
 
275 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  40.48 
 
 
503 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  40.25 
 
 
501 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.67 
 
 
517 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  40.5 
 
 
503 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  37.97 
 
 
501 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  43.7 
 
 
507 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>