More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1210 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  48.56 
 
 
280 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  46.53 
 
 
245 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  46.5 
 
 
262 aa  235  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  53.78 
 
 
244 aa  235  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  47.67 
 
 
257 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
261 aa  231  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  48.4 
 
 
263 aa  228  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  49.17 
 
 
240 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  51.24 
 
 
247 aa  227  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  48.59 
 
 
260 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  47.54 
 
 
262 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  49.22 
 
 
264 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  46.53 
 
 
264 aa  225  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  45.68 
 
 
264 aa  224  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 
267 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  48.16 
 
 
271 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  46.67 
 
 
243 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  45.9 
 
 
266 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  50.2 
 
 
260 aa  221  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  46.94 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  47.95 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  47.33 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  47.76 
 
 
271 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  49.37 
 
 
249 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  47.83 
 
 
260 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  43.03 
 
 
288 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  46.67 
 
 
265 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 
278 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  43.5 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  45.93 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  46.43 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  42.46 
 
 
262 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  47.74 
 
 
254 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  44.49 
 
 
266 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  42.37 
 
 
265 aa  215  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.9 
 
 
275 aa  214  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  46.91 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  45.2 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.45 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  47.95 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.5 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  46.18 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  45.85 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  44.03 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  48.31 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  44.19 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  49.57 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  46.5 
 
 
247 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  48.22 
 
 
261 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45.24 
 
 
268 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  49.2 
 
 
269 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  49.08 
 
 
261 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  48.56 
 
 
257 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  44.71 
 
 
257 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  51.12 
 
 
273 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  46.59 
 
 
261 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  47.6 
 
 
264 aa  208  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  47.93 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  44.57 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
269 aa  206  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  44.44 
 
 
316 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  46.94 
 
 
252 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  43.92 
 
 
265 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
278 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  45.27 
 
 
266 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  44.22 
 
 
271 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44 
 
 
258 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
265 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  44 
 
 
258 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  45.38 
 
 
265 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  44.03 
 
 
301 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
266 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 
265 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  46.37 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  50.22 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  45.93 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  42.91 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  43.62 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  44.98 
 
 
253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  44.9 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  48.93 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.18 
 
 
261 aa  199  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  44.03 
 
 
246 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  48.74 
 
 
249 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  43.56 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  48.44 
 
 
275 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  48.78 
 
 
260 aa  198  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  48.79 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  46.61 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>