More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3702 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 
265 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  99.62 
 
 
265 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  86.27 
 
 
277 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  81.1 
 
 
276 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  80.78 
 
 
273 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  81.57 
 
 
288 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  79.22 
 
 
273 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  80.78 
 
 
286 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  64.79 
 
 
276 aa  331  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  68.8 
 
 
261 aa  329  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  65.62 
 
 
262 aa  321  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  65.62 
 
 
265 aa  321  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  62.35 
 
 
271 aa  299  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  62.86 
 
 
276 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  62.15 
 
 
263 aa  287  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  65.29 
 
 
272 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  61.92 
 
 
260 aa  285  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  54.76 
 
 
263 aa  276  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  56.47 
 
 
278 aa  275  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
260 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  58.57 
 
 
260 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  54.55 
 
 
260 aa  255  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  54.12 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  54.1 
 
 
260 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
275 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  54.36 
 
 
265 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  56.47 
 
 
257 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  54.36 
 
 
261 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  54.43 
 
 
254 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  51.75 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  55.33 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  58.18 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
269 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  50.79 
 
 
266 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  57.6 
 
 
257 aa  234  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  55.76 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  55.3 
 
 
271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  50.61 
 
 
258 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  52.42 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  52.97 
 
 
264 aa  232  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  51.88 
 
 
269 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  51.63 
 
 
253 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  50.41 
 
 
271 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  50 
 
 
247 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  45.78 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1857  sugar ABC transporter ATPase  51.46 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  49.58 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  48.77 
 
 
246 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  52.75 
 
 
261 aa  217  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  47.95 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  45.88 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.9 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  48.36 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 
261 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  48.32 
 
 
247 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  45.38 
 
 
257 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
283 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  46.12 
 
 
262 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  50.62 
 
 
278 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  44.26 
 
 
280 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 
266 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  46.31 
 
 
249 aa  204  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  45.28 
 
 
265 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  42.5 
 
 
261 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  43.88 
 
 
258 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  46.31 
 
 
259 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  44.31 
 
 
260 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  44.73 
 
 
258 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  45.31 
 
 
254 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 
278 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.93 
 
 
266 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
266 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
256 aa  201  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
266 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
266 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
266 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
266 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
266 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  45.12 
 
 
288 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  46.94 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  44.53 
 
 
259 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  44.49 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  45.78 
 
 
259 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  44.66 
 
 
265 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  42.8 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.91 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  44.18 
 
 
260 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  45.25 
 
 
274 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.78 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  44.26 
 
 
267 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  45.34 
 
 
260 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  47.35 
 
 
254 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  44.8 
 
 
274 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  43.55 
 
 
315 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  44.53 
 
 
273 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  44.53 
 
 
258 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>