More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0538 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  80.75 
 
 		 265 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  79.3 
 
 		 284 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  83.98 
 
 		 263 aa  407  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  77.04 
 
 		 274 aa  401  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  77.74 
 
 		 272 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  75.49 
 
 		 285 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  81.64 
 
 		 263 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  82.07 
 
 		 265 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  73.54 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  71.76 
 
 		 266 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  72.37 
 
 		 265 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  69.84 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  69.05 
 
 		 265 aa  349  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  67.05 
 
 		 268 aa  342  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  66.94 
 
 		 265 aa  338  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  67.07 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  67.45 
 
 		 259 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  65.5 
 
 		 260 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  65.35 
 
 		 257 aa  335  5e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  62.69 
 
 		 273 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  65.45 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  66.27 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  66.27 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  63.24 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  67.62 
 
 		 266 aa  322  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  64.29 
 
 		 258 aa  322  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  66.4 
 
 		 275 aa  321  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  64.71 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  66.79 
 
 		 275 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  64.71 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  65.45 
 
 		 257 aa  309  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  55.2 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  61.18 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  53.25 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  54.8 
 
 		 253 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  50.4 
 
 		 271 aa  248  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  49 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  45.85 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  48.61 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  47.98 
 
 		 278 aa  222  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  43.7 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  45.2 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  43.19 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.56 
 
 		 244 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  41.47 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  41.02 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  42.41 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  45.93 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  44.11 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  39.53 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  43.44 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.15 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  39.61 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  44.98 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  44.53 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  46.56 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 283 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  40.23 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 258 aa  198  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  43.62 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  46.34 
 
 		 271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  45.12 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  46.54 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  41.73 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  43.31 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.59 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  43.6 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  41.22 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.55 
 
 		 278 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  43.81 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  42.86 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  43.85 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  40.31 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.53 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  39.51 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  45.9 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.5 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  42.86 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  38.34 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.3 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  43.8 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  42.58 
 
 		 315 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  40.48 
 
 		 271 aa  191  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  41.39 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  46.38 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>