More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1808 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  68.18 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  69.2 
 
 		 260 aa  359  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  66.67 
 
 		 315 aa  352  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  67.87 
 
 		 255 aa  345  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  66.01 
 
 		 258 aa  339  4e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  65.22 
 
 		 301 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  66.02 
 
 		 316 aa  332  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  63.92 
 
 		 271 aa  331  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  65.08 
 
 		 269 aa  328  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  64.68 
 
 		 289 aa  323  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  62.85 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  61.57 
 
 		 262 aa  321  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  62.4 
 
 		 274 aa  315  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  59.53 
 
 		 280 aa  315  7e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  62.45 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  59.47 
 
 		 282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  58.59 
 
 		 264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  58.75 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  57.85 
 
 		 266 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  55.94 
 
 		 265 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  57.09 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  58.5 
 
 		 282 aa  299  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.89 
 
 		 259 aa  298  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  58.89 
 
 		 259 aa  298  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  58.62 
 
 		 267 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.82 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.82 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  56.22 
 
 		 266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  54.55 
 
 		 288 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  54.94 
 
 		 267 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  55.89 
 
 		 267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  55.56 
 
 		 266 aa  278  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  53.46 
 
 		 264 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  53.91 
 
 		 262 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 260 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  44.03 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  41.86 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 		 265 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.31 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  46.09 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.15 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  42.91 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  46.58 
 
 		 247 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  41.18 
 
 		 265 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  40.86 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  42.57 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  42.97 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  46.19 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.7 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.3 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  41.57 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  40.48 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.03 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.49 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  41.8 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  40.8 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  41.11 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  46.26 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.1 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  39.75 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  43.03 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  40.15 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.3 
 
 		 249 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  41.31 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  45.19 
 
 		 257 aa  192  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  41.54 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  40.54 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  41.5 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.11 
 
 		 258 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  43.3 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  41 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  40.3 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  41.11 
 
 		 258 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  40.61 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  42.45 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  40.32 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  41.49 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  40.32 
 
 		 268 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  41.18 
 
 		 259 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  39.77 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  41.63 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  39.15 
 
 		 260 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>