More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0435 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  97.74 
 
 
266 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  89.43 
 
 
278 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  89.39 
 
 
267 aa  483  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  90.42 
 
 
288 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  69.02 
 
 
265 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  60.47 
 
 
280 aa  338  4e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.94 
 
 
259 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  61.42 
 
 
262 aa  325  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  58.94 
 
 
259 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  61.66 
 
 
260 aa  323  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  59.84 
 
 
266 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  58.75 
 
 
264 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  58.94 
 
 
262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  58.46 
 
 
282 aa  315  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  60.08 
 
 
301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  54.41 
 
 
266 aa  303  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  54.72 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  55.21 
 
 
262 aa  301  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  52.47 
 
 
264 aa  299  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  56.69 
 
 
316 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  55.51 
 
 
305 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  53.73 
 
 
266 aa  291  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  55.91 
 
 
255 aa  285  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  55.34 
 
 
315 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  55.95 
 
 
289 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  56.61 
 
 
294 aa  278  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  54.02 
 
 
282 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
269 aa  276  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
258 aa  274  9e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  53.23 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  54.51 
 
 
274 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  52.16 
 
 
274 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  53.54 
 
 
267 aa  251  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  51.78 
 
 
267 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  45.04 
 
 
249 aa  222  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  48.55 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  43.5 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  45.71 
 
 
273 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  44.22 
 
 
254 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  43.82 
 
 
244 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  42.46 
 
 
260 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  43.44 
 
 
259 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 
258 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  41.18 
 
 
260 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
265 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  39.92 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  45.93 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.58 
 
 
273 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  42.29 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  41.43 
 
 
264 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  40.82 
 
 
258 aa  198  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  41.41 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  42.86 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  40.24 
 
 
268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  42.52 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  41.5 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  41.46 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  41.86 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.47 
 
 
265 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.37 
 
 
259 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  37.4 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  40.32 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  40.73 
 
 
265 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
250 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  42.34 
 
 
261 aa  195  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.04 
 
 
524 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  40.98 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  41.47 
 
 
272 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  45.45 
 
 
273 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  42.29 
 
 
257 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.68 
 
 
524 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.68 
 
 
524 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.93 
 
 
527 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  40.74 
 
 
254 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  43.44 
 
 
261 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  37.25 
 
 
524 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
261 aa  191  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.61 
 
 
524 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  37.55 
 
 
518 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  41.73 
 
 
274 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  43.09 
 
 
260 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  40.47 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  45.25 
 
 
256 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  40.23 
 
 
265 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  39.51 
 
 
524 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
283 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  41.3 
 
 
260 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  45.54 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
285 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  43.08 
 
 
278 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  39.44 
 
 
260 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  39.1 
 
 
257 aa  188  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>