More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3600 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  100 
 
 		 289 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  87.35 
 
 		 269 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  78.79 
 
 		 274 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  79.17 
 
 		 274 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  69.29 
 
 		 271 aa  364  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  69.96 
 
 		 274 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  64.29 
 
 		 282 aa  352  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  64.18 
 
 		 305 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  63.53 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  63.67 
 
 		 267 aa  334  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  64.94 
 
 		 258 aa  332  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  63.22 
 
 		 267 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  65.2 
 
 		 255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  62.89 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  62.11 
 
 		 260 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  65 
 
 		 294 aa  308  5e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  62.06 
 
 		 316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  58.73 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  55.38 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  53.94 
 
 		 262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 		 259 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  55.56 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  55.56 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.35 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  54.76 
 
 		 266 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.95 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.95 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.37 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  54.37 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  55.16 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  54.76 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  52.59 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  52.38 
 
 		 266 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  50.97 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  51.97 
 
 		 264 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  51.19 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  47.08 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  44.59 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  41.97 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  43.48 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  40.93 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  42.04 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  43.24 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  39.57 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  44.86 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.97 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  42.97 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  43.39 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  42.62 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  44.21 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  43.39 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  41.28 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  41.25 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  43.5 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  40.56 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  41.25 
 
 		 269 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  39.84 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  41.31 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.69 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  38.49 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  41.7 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  41.49 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  40.25 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  39.13 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  40.98 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  39.59 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  41.22 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.39 
 
 		 254 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  40.5 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  38.81 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  41.46 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  40.32 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  40.74 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  43.53 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  40.96 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  42.13 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  39.84 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  41.28 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  38.62 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  44.75 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  38.25 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  39.91 
 
 		 261 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  38.85 
 
 		 275 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  39.84 
 
 		 260 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  40.62 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>