More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0846 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  76.64 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  77.69 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  70.12 
 
 		 257 aa  332  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  58.44 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  41.94 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  43.15 
 
 		 254 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  43.61 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  41.78 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  42.6 
 
 		 284 aa  185  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  44.5 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  40.09 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  45.21 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.25 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  42.8 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  41.91 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  41.89 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  41.84 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  39.91 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  38.98 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  40.36 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  41.84 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  40 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  41.49 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  39.83 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  42.74 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  39.75 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  40.81 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.52 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  41.78 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  40.6 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  39.09 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  42.86 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  40.36 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  40.53 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.1 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  40.69 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  41.03 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  40.18 
 
 		 265 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  41.1 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  40.69 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  39.47 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  40.5 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  39.82 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  41.07 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  40.5 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  41.7 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  41.52 
 
 		 277 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  40.61 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.4 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  39.92 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.4 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  38.25 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  40.54 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  39.68 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  40.18 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  41.63 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  40.62 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  39.06 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  36.86 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.89 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  41.52 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  41.63 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  40.18 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  41.07 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  39.47 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  38.43 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  39.08 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  41.52 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  39.01 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  41.26 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>