More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3623 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  100 
 
 
266 aa  524  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  81.37 
 
 
275 aa  400  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  69.41 
 
 
285 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  69.02 
 
 
265 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  71.43 
 
 
274 aa  358  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  73.88 
 
 
275 aa  350  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  69.08 
 
 
265 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  69.35 
 
 
260 aa  349  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  68.27 
 
 
265 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  68.02 
 
 
266 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  68.53 
 
 
284 aa  346  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  68.95 
 
 
272 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  68.72 
 
 
263 aa  330  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  65.23 
 
 
265 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  66.27 
 
 
273 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  63.92 
 
 
265 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  66.13 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  65.6 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  67.76 
 
 
274 aa  324  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  63.31 
 
 
268 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  64.52 
 
 
260 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  62.06 
 
 
259 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  64.37 
 
 
258 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  65.88 
 
 
265 aa  318  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  64.37 
 
 
258 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  63.75 
 
 
260 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  62.99 
 
 
264 aa  317  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  65.04 
 
 
259 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  60.7 
 
 
257 aa  316  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  63.56 
 
 
258 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  61.72 
 
 
257 aa  311  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  60.55 
 
 
261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  63.56 
 
 
257 aa  289  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  57.26 
 
 
253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  52.96 
 
 
260 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  54.88 
 
 
258 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  54.47 
 
 
254 aa  259  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  52.78 
 
 
260 aa  248  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  51.61 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  48.78 
 
 
263 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  49.8 
 
 
278 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  45.38 
 
 
247 aa  221  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  46.33 
 
 
262 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  48.79 
 
 
244 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  48.57 
 
 
254 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  50.41 
 
 
264 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
260 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  48.77 
 
 
271 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  50.62 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  47.37 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
250 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  48.36 
 
 
254 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  45.88 
 
 
252 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  47.35 
 
 
313 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 
275 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
276 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
266 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
265 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  48.36 
 
 
271 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  46.18 
 
 
261 aa  208  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.2 
 
 
245 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  48.77 
 
 
261 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
278 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  45.9 
 
 
260 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  49.18 
 
 
257 aa  205  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  45.9 
 
 
265 aa  205  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  43.43 
 
 
262 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  48.57 
 
 
261 aa  205  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  48.36 
 
 
269 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  45.2 
 
 
249 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  46.94 
 
 
257 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.34 
 
 
265 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  45.16 
 
 
273 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  46.34 
 
 
261 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  46.34 
 
 
265 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  45.56 
 
 
273 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.85 
 
 
259 aa  203  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  48.39 
 
 
272 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  42.11 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.21 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  39.77 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.76 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  45.31 
 
 
277 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.18 
 
 
288 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
247 aa  198  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  46.09 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  43.89 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  42.04 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  41.8 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  47.3 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.08 
 
 
259 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  46.86 
 
 
246 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  48.39 
 
 
256 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
271 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  46.47 
 
 
247 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>