More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3969 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  62 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  58.89 
 
 		 271 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  54.76 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  51.84 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  51.57 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  49.8 
 
 		 265 aa  254  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  52.55 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  51.41 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.81 
 
 		 258 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  51.81 
 
 		 258 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  52.59 
 
 		 265 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  51.21 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  55.33 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  50.79 
 
 		 259 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  49.8 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  51.22 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  50.39 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.61 
 
 		 268 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  54.29 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  50.2 
 
 		 265 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  50.81 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  50.61 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  52.78 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  49.19 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  48.97 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  48.39 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  53.69 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  48.81 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  46.06 
 
 		 257 aa  234  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  52.72 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  50.61 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  52.42 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  51.84 
 
 		 261 aa  231  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  50.41 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  52.23 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  48.57 
 
 		 254 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  49 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  49.22 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  49.4 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  47.24 
 
 		 261 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  51.23 
 
 		 275 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  51.19 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  52.05 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  51.43 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 276 aa  225  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  51.45 
 
 		 264 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  49.38 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 260 aa  224  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  51.64 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  49 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  49.61 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.24 
 
 		 286 aa  221  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  46.25 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  49.8 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  50.6 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  48.58 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 260 aa  218  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  49.18 
 
 		 313 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  48.36 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  50.41 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  47.13 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  49.38 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  49.8 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  50.4 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  48.59 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  50.21 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  45.71 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  53.09 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 276 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.56 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.22 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 266 aa  207  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  44.08 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  46.59 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.9 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  42.97 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  46.94 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  45 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  44.86 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  45.93 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  44.35 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  46.31 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>