More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2607 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  82.63 
 
 		 259 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  84.06 
 
 		 264 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  82.28 
 
 		 258 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  82.28 
 
 		 258 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  82.94 
 
 		 261 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  81.75 
 
 		 258 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  79.84 
 
 		 268 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  80.39 
 
 		 257 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  79.2 
 
 		 260 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  81.45 
 
 		 260 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  80.97 
 
 		 265 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  78 
 
 		 273 aa  411  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  80 
 
 		 259 aa  408  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  74.8 
 
 		 265 aa  387  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  68.42 
 
 		 265 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  66.27 
 
 		 265 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  65.46 
 
 		 266 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  64.17 
 
 		 257 aa  324  9e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  65.99 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  65.23 
 
 		 274 aa  322  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  64.71 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  63.67 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  62.7 
 
 		 285 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  68.53 
 
 		 272 aa  307  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  64.14 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  64.71 
 
 		 274 aa  298  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  63.71 
 
 		 266 aa  297  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  63.56 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  65.16 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  61.38 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  63.67 
 
 		 275 aa  290  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  66.27 
 
 		 265 aa  289  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  52.63 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  51.21 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  49.02 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  50.41 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  49.61 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  47.39 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  45.2 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  44.53 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  44.14 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  44.22 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  46.12 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  46.34 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  49.57 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  46.72 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  43.75 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  40.86 
 
 		 258 aa  207  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  43.43 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  42.75 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  44.94 
 
 		 266 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  45.2 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 		 275 aa  202  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  42.74 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  41.83 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  44.14 
 
 		 280 aa  198  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  43.15 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  42.74 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  44.08 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.82 
 
 		 245 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.13 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.13 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  42.25 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.09 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  46.36 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  43.78 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.72 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  41.6 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  44.39 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  42.51 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.72 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  42.28 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  45.09 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  44.89 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  39.53 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  42.21 
 
 		 288 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  42.57 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>