More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1504 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  517  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  84.05 
 
 		 275 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  79.37 
 
 		 260 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  78.05 
 
 		 254 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  78.54 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  74.42 
 
 		 261 aa  381  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  76.02 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  75.61 
 
 		 271 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  76.56 
 
 		 257 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  72.94 
 
 		 266 aa  374  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  75.5 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  75.4 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  75.81 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  71.25 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  70.12 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  62.55 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  60.42 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  56.79 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 265 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  59.27 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 278 aa  272  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  58.58 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  57.74 
 
 		 269 aa  263  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  54.69 
 
 		 260 aa  262  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  56.72 
 
 		 273 aa  258  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  57.96 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  59.63 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  52.8 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.63 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  58.72 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.47 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  56.47 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  55.27 
 
 		 277 aa  244  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  49.17 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  48.78 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  53.11 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.72 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  47.67 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  48.82 
 
 		 271 aa  231  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  48.37 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  50.41 
 
 		 254 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  51.9 
 
 		 252 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  44.71 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  47.95 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  47.97 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  50.83 
 
 		 263 aa  224  9e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  45.19 
 
 		 257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  45.9 
 
 		 265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  45.06 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.16 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  46.59 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  44.66 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  45.56 
 
 		 268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  46.77 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  45.16 
 
 		 264 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  47.43 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  44.79 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  46.12 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  44.22 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  42.75 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  47.35 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  45.06 
 
 		 259 aa  211  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.82 
 
 		 265 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  49.39 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  45.78 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  46.12 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  45.02 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  45.9 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  46.69 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  41.96 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  44.9 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 283 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  41.9 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  43.98 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  44.8 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  42.4 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  44.22 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  46.32 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  44.44 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  40 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  40.73 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  43.78 
 
 		 265 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  40.5 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  43.39 
 
 		 245 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  45.49 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  41.6 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  41.06 
 
 		 503 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>