More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3432 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  517  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  55.24 
 
 
255 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  48.88 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  43.09 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  43.9 
 
 
243 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  46.72 
 
 
240 aa  208  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
264 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  43.86 
 
 
258 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  45.7 
 
 
263 aa  205  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  45.54 
 
 
262 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  40.73 
 
 
257 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
260 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 
275 aa  201  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  41.8 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  42.91 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  41.46 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 
259 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  40.16 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  41.53 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  42.56 
 
 
261 aa  194  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  45.13 
 
 
265 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 
260 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  42.21 
 
 
259 aa  192  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 
278 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  44.8 
 
 
288 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  40.24 
 
 
282 aa  191  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  41.63 
 
 
260 aa  191  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.25 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  44.64 
 
 
254 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  41.95 
 
 
260 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  45.5 
 
 
260 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  47.3 
 
 
273 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  39.66 
 
 
502 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  46.08 
 
 
260 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.08 
 
 
268 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  46.26 
 
 
261 aa  188  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  45.05 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  44.34 
 
 
267 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
266 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
266 aa  188  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  42.19 
 
 
259 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  43.36 
 
 
301 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  38.87 
 
 
261 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  41.48 
 
 
244 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  40.96 
 
 
294 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  43.36 
 
 
257 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  38.1 
 
 
252 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  39.02 
 
 
271 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
258 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  42.98 
 
 
495 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  43.44 
 
 
264 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  45.5 
 
 
264 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  44.14 
 
 
258 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  42.98 
 
 
316 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  45.02 
 
 
257 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  42.86 
 
 
269 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  43.64 
 
 
255 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  42.86 
 
 
265 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0353  ABC transporter related  40 
 
 
302 aa  185  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  38.93 
 
 
313 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.36 
 
 
259 aa  185  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.67 
 
 
260 aa  185  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.48 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  41.95 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  39.43 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  41.03 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  39.02 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  40.68 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  41.67 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  40.93 
 
 
500 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  40.57 
 
 
500 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  40.57 
 
 
500 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.53 
 
 
254 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  40.57 
 
 
500 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  44.25 
 
 
260 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  40.57 
 
 
500 aa  181  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
504 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  41.56 
 
 
282 aa  181  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  41.81 
 
 
262 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  39.61 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  42.48 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
500 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
500 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  40.95 
 
 
264 aa  181  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  41.59 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 
500 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  41.42 
 
 
495 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.05 
 
 
496 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  45.13 
 
 
261 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
265 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  40.42 
 
 
258 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  41.6 
 
 
247 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>