More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0914 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  68.62 
 
 		 243 aa  346  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  49.17 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  48.76 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  46.72 
 
 		 256 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  44.39 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  45.19 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  42.68 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  42.92 
 
 		 245 aa  198  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  42.26 
 
 		 266 aa  197  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  42.68 
 
 		 262 aa  197  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  44.4 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  43.51 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  41.06 
 
 		 266 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  39.17 
 
 		 288 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 278 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  44.58 
 
 		 316 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  43.64 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  39.92 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  43.21 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  38.91 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  45.87 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  39.33 
 
 		 262 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0353  ABC transporter related  41.13 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  40.17 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  39.75 
 
 		 501 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  41.6 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  44.44 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  41.88 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.33 
 
 		 501 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 266 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  44 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  43.3 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  42.48 
 
 		 284 aa  178  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  40.42 
 
 		 266 aa  177  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  41.95 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  38.91 
 
 		 501 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  38.91 
 
 		 501 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 516 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  38.91 
 
 		 501 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  40.34 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  40.76 
 
 		 282 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 516 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  43.56 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  40.42 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  43.11 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.26 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 516 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 501 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 516 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  42.13 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 501 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  43.3 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.66 
 
 		 501 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 501 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 501 aa  175  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 501 aa  175  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 501 aa  175  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  37.66 
 
 		 501 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  37.66 
 
 		 501 aa  174  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  40 
 
 		 245 aa  174  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  41.28 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  42.67 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 504 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.95 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  42.55 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  37.08 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  36.82 
 
 		 501 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  44.39 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  40.09 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 		 274 aa  171  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  39.37 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.96 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.25 
 
 		 502 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  37.29 
 
 		 495 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  42.59 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  41.78 
 
 		 526 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  40.91 
 
 		 294 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  41.59 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  39.15 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  41 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  39.73 
 
 		 497 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  42.55 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>