More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4706 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  98.6 
 
 		 500 aa  995    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  98.4 
 
 		 500 aa  993    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  98.2 
 
 		 500 aa  990    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  99 
 
 		 500 aa  1002    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  61.57 
 
 		 507 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  67.41 
 
 		 506 aa  674    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  67.21 
 
 		 506 aa  676    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  66.8 
 
 		 496 aa  685    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  86.03 
 
 		 501 aa  877    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  88.2 
 
 		 500 aa  890    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  67.01 
 
 		 496 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  66.8 
 
 		 496 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  66.6 
 
 		 503 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  62.17 
 
 		 507 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 500 aa  1013    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  99 
 
 		 500 aa  1002    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  98.4 
 
 		 500 aa  993    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  93.2 
 
 		 500 aa  948    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  60.2 
 
 		 505 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.22 
 
 		 516 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  56.83 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  55.22 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  52.43 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  52.09 
 
 		 510 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  52.6 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  52.63 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  52.63 
 
 		 499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  53.53 
 
 		 504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 501 aa  511  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  52.43 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  51.5 
 
 		 523 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 		 503 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  50.7 
 
 		 525 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  50.7 
 
 		 525 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  50.4 
 
 		 526 aa  478  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  50.7 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  50.7 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  51.79 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  50.7 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  51.64 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  51.63 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  51.72 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  51.43 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  50.1 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  47.93 
 
 		 513 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  49.8 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.89 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  51.45 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  51.66 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  47.42 
 
 		 529 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  45.31 
 
 		 544 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  46.14 
 
 		 497 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.82 
 
 		 544 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  48.48 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.98 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.93 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  43.02 
 
 		 585 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 494 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.48 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 526 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.54 
 
 		 518 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 525 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  41.65 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.8 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  42.77 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.8 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.88 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.29 
 
 		 513 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  41.39 
 
 		 513 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.8 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  42.12 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.2 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.98 
 
 		 513 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.89 
 
 		 507 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.47 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  43.41 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  43.41 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  44.96 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 498 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  44.13 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  42.89 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.75 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  42.03 
 
 		 505 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.36 
 
 		 519 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.51 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.26 
 
 		 524 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  42.26 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  41.41 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.05 
 
 		 524 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.7 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>