More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0353 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0353  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0319  ABC transporter related  45.83 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.87 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  40.91 
 
 		 243 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  44.49 
 
 		 255 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  41.57 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  43.51 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 247 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 301 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  39.57 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  41.15 
 
 		 247 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  41.13 
 
 		 240 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  40.68 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  40.42 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  40.32 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  41.18 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  39.5 
 
 		 264 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  39.36 
 
 		 267 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  41.23 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  41.15 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  41.49 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  39.61 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  38.65 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  39.29 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  41.77 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  40.59 
 
 		 245 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  42.8 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  40.64 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  40.82 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  41.53 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  37.76 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 258 aa  165  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  40.59 
 
 		 316 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  39.51 
 
 		 262 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  40.33 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.77 
 
 		 265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  41.18 
 
 		 273 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  38.24 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  40.89 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  36.06 
 
 		 510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  36.48 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  39.75 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  38.55 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  38.08 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 269 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  38.59 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  40.25 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  37.04 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  41.67 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  38.37 
 
 		 246 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.37 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 		 501 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  36.93 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  40.09 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  41.41 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  39.92 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  37.5 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  39.41 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  39.01 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  39.75 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  40.09 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  33.72 
 
 		 504 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  39.42 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  37.7 
 
 		 262 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  39.83 
 
 		 256 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 276 aa  159  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  38.08 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  37.69 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  36.64 
 
 		 508 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0397  ABC transporter related  39.84 
 
 		 502 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  40.34 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  38.11 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  39.43 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  39.47 
 
 		 508 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.52 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  37.82 
 
 		 585 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  37.45 
 
 		 525 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  37.92 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 525 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  37.34 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  36.63 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 		 510 aa  155  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  35.83 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>