More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2715 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  67.36 
 
 		 247 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  67.36 
 
 		 246 aa  332  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  66.94 
 
 		 246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  52.21 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  50.2 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  49.42 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  50.2 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  49.17 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  50.61 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  46.4 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  46.59 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  48.57 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  48.99 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  48.79 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  49 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  48 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  47.56 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  45.9 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  50.63 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 		 275 aa  215  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  45.71 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  47.15 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  51.24 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  47.52 
 
 		 259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  50.61 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.6 
 
 		 271 aa  211  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.2 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  45.56 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  46.72 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.25 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  45.75 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  45.93 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  45.06 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  45.97 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  44.72 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  44.66 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  42.8 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.25 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  48.36 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  46.56 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  46.89 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  45.56 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  44.31 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  43.9 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  42.8 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  44.17 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  44.13 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  45.82 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  43.1 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  46.56 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  45.83 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  40.65 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  44.84 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  45.87 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  42.17 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.15 
 
 		 517 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  42.74 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  46.5 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 497 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 285 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  42.97 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  42.51 
 
 		 266 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  40.94 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.9 
 
 		 271 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.76 
 
 		 502 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  43.2 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  41.53 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  43.82 
 
 		 276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1487  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 498 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.32 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  42.06 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  38.68 
 
 		 501 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2223  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0935635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  42.91 
 
 		 265 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  40.24 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  40.73 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  42.51 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1901  ABC transporter related  44.49 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0159617  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  42.02 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.75 
 
 		 501 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  37.86 
 
 		 501 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 510 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  43.85 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>