More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1487 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1487  ABC transporter related protein  100 
 
 
498 aa  1003    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.96 
 
 
497 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.41 
 
 
492 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  42.45 
 
 
501 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  42.54 
 
 
493 aa  388  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
492 aa  385  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  40.52 
 
 
503 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.87 
 
 
496 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  38.79 
 
 
507 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.94 
 
 
499 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.55 
 
 
496 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.94 
 
 
499 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  42.16 
 
 
494 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  40.68 
 
 
505 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.55 
 
 
514 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.87 
 
 
527 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  38.71 
 
 
504 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 
494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 
501 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.21 
 
 
501 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
494 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  38.46 
 
 
524 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.99 
 
 
503 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  43.35 
 
 
504 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.96 
 
 
501 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.95 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
494 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.87 
 
 
524 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  40.29 
 
 
499 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.76 
 
 
512 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  41.26 
 
 
500 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.26 
 
 
524 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  38.38 
 
 
512 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  44.24 
 
 
500 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.84 
 
 
514 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  38.26 
 
 
524 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  38.38 
 
 
513 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.61 
 
 
494 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.26 
 
 
524 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  38.38 
 
 
512 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  39.67 
 
 
501 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  38.76 
 
 
508 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  39.15 
 
 
496 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40 
 
 
501 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40 
 
 
501 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.65 
 
 
516 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  38.38 
 
 
513 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.68 
 
 
495 aa  368  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40 
 
 
501 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40 
 
 
501 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  39.39 
 
 
501 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  39.4 
 
 
501 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 
523 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.65 
 
 
516 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  39.27 
 
 
513 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  35.37 
 
 
498 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.65 
 
 
516 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
500 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2999  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
515 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.776135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.06 
 
 
524 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40 
 
 
501 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.26 
 
 
503 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.5 
 
 
512 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  39.36 
 
 
501 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  39.8 
 
 
501 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.65 
 
 
516 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.2 
 
 
501 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.65 
 
 
501 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  37.65 
 
 
512 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
496 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.44 
 
 
501 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  39.96 
 
 
495 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  37.65 
 
 
516 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  40.67 
 
 
509 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 
500 aa  364  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  39.8 
 
 
501 aa  363  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  38.88 
 
 
511 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  39.88 
 
 
499 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  39.8 
 
 
501 aa  363  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  38.76 
 
 
515 aa  363  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  39.36 
 
 
496 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.32 
 
 
502 aa  363  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
496 aa  363  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 
496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  39.07 
 
 
513 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4914  xylose transporter ATP-binding subunit  38.86 
 
 
515 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00466146  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3837  xylose transporter ATP-binding subunit  38.86 
 
 
515 aa  362  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.377794 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  42.12 
 
 
511 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  38.87 
 
 
501 aa  362  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.17 
 
 
513 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2216  galactoside ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
497 aa  361  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  37.42 
 
 
511 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2340  xylose transporter ATP-binding subunit  38.19 
 
 
525 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264239  normal  0.0150515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  40.16 
 
 
506 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  36.97 
 
 
495 aa  360  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  37.75 
 
 
499 aa  360  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>