More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6162 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  83.96 
 
 		 271 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  78.66 
 
 		 261 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  78.66 
 
 		 261 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  61.45 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  64.14 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0775  ABC transporter  63.22 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0591265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  49.39 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 		 244 aa  229  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  47.54 
 
 		 259 aa  225  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  47.26 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  46.69 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  45.9 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  47.26 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  47.06 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  47.95 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 266 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  48.73 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  47.88 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 		 252 aa  211  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  46.4 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  47.74 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  44.3 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  47.28 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.35 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  43.03 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  44.4 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  46.25 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  46.69 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  41.91 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  46.06 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  44.21 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  45.38 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 256 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  43.43 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  47.03 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  46.81 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  45.45 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  43.21 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  44.07 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  47.79 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  44.18 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.96 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  47.49 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  44.81 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.12 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  43.82 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  43.04 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  45.45 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  44.73 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  43.51 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  42.62 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  48 
 
 		 275 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  43.04 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  49.59 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  43.15 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  42.11 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  42.26 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  43.25 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 506 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.34 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 276 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  43.03 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  42.74 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  42.19 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.56 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  45.19 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.21 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  40.56 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  39.61 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  44.35 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.13 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.76 
 
 		 495 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  41 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  40.98 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  42.21 
 
 		 502 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  41.98 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 501 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  38.56 
 
 		 501 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  38.56 
 
 		 501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  41.6 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  38.56 
 
 		 501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  39.33 
 
 		 506 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  38.56 
 
 		 501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>