More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1479 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0775  ABC transporter  72.06 
 
 
258 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0591265 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  64.49 
 
 
254 aa  299  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.82 
 
 
271 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  63.03 
 
 
261 aa  287  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  63.03 
 
 
261 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  64.14 
 
 
273 aa  277  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  51.67 
 
 
247 aa  247  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  52.99 
 
 
244 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  49.79 
 
 
259 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  47.48 
 
 
294 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  47.9 
 
 
249 aa  224  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  48.52 
 
 
271 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  48.18 
 
 
276 aa  218  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  49.39 
 
 
261 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  46.81 
 
 
246 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  48.74 
 
 
259 aa  217  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  46.34 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.32 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  44.35 
 
 
263 aa  211  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  44.3 
 
 
247 aa  209  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  44.73 
 
 
246 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  46.5 
 
 
271 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
256 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  48.31 
 
 
258 aa  208  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  47.46 
 
 
261 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  47.7 
 
 
260 aa  206  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  46.99 
 
 
276 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  45.99 
 
 
260 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  46.61 
 
 
264 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
265 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  43.46 
 
 
247 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.68 
 
 
271 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  44.35 
 
 
260 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
497 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 
288 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  45.68 
 
 
260 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  45.45 
 
 
252 aa  202  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 
261 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  47.68 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.53 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  48.39 
 
 
277 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
254 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  44.3 
 
 
245 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  47.21 
 
 
266 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  45.76 
 
 
257 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  46.15 
 
 
262 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  44.08 
 
 
266 aa  198  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.99 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  48.32 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  47.75 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  46.44 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  45.02 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  42.91 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  44.3 
 
 
257 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  44.21 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  45.57 
 
 
285 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  44.21 
 
 
260 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  43.33 
 
 
260 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
276 aa  194  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 
258 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  44.4 
 
 
259 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
248 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 
265 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  47.46 
 
 
257 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 
252 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  43.32 
 
 
273 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  45.76 
 
 
261 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  43.82 
 
 
261 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  44.92 
 
 
269 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  44.07 
 
 
254 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  43.51 
 
 
266 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  44.22 
 
 
273 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  42.4 
 
 
506 aa  191  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  42.19 
 
 
265 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.75 
 
 
503 aa  191  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  43.93 
 
 
265 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0822  ABC transporter related  37.86 
 
 
502 aa  191  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.688061  hitchhiker  0.00171866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  38.68 
 
 
506 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  43.72 
 
 
273 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  42.08 
 
 
494 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.98 
 
 
260 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  46.3 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  44.22 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  41.42 
 
 
253 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  41.32 
 
 
266 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 
271 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  44.26 
 
 
257 aa  189  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  43.32 
 
 
260 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  41.88 
 
 
243 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
260 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  41.35 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  42.26 
 
 
257 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  41.91 
 
 
506 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 
274 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  41.77 
 
 
264 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  40.93 
 
 
282 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
250 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>