More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5833 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  68.62 
 
 		 240 aa  346  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  46.06 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  46.67 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  47.76 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  44.9 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.51 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  45.12 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  42.8 
 
 		 245 aa  211  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  43.9 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  40.83 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  45.58 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  43.72 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  42.74 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  41.91 
 
 		 282 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  40.83 
 
 		 262 aa  200  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  41.98 
 
 		 258 aa  200  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  47.22 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  40.83 
 
 		 266 aa  198  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  44.02 
 
 		 262 aa  198  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.35 
 
 		 261 aa  198  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  47.71 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.71 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  47.44 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  47.47 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0353  ABC transporter related  40.91 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  41.74 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  42.56 
 
 		 260 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  41 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  46.36 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  44.2 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  41.74 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  41.32 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  42.15 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  42.49 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  40.25 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  42.26 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  47.73 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  42.37 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  39.92 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.7 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  44.09 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  46.36 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  45.16 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  39.83 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  44.75 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.44 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  42.44 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  43.58 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  40 
 
 		 253 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  42.22 
 
 		 274 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  45.16 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 261 aa  188  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  45 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  40.57 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  46.08 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  40.17 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  44.67 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  43.78 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  40.66 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  40.91 
 
 		 271 aa  185  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  40.33 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.36 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  37.08 
 
 		 266 aa  184  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 		 274 aa  184  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  44.7 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  41.84 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  40.25 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  42.19 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  40.08 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  41.32 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  44.65 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.5 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  40.08 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 504 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  39.51 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  41.38 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  41.07 
 
 		 506 aa  181  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>