More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6322 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  93.75 
 
 		 273 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  81.04 
 
 		 276 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  80.88 
 
 		 288 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  80.51 
 
 		 286 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  79.22 
 
 		 265 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  79.22 
 
 		 265 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  77.95 
 
 		 277 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  64.13 
 
 		 276 aa  338  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  67.6 
 
 		 261 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  64.89 
 
 		 262 aa  325  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  63.22 
 
 		 265 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  62.92 
 
 		 271 aa  288  7e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  63.03 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  65.29 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  56.18 
 
 		 263 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  59.76 
 
 		 260 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  59.77 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  59.18 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  56.91 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  56.72 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  54.47 
 
 		 261 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 		 260 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  56.96 
 
 		 254 aa  254  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  53.03 
 
 		 269 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  55.24 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  58.53 
 
 		 261 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  55.2 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  52.46 
 
 		 266 aa  244  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  55.32 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  50.8 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  55.42 
 
 		 257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  51.6 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  53.06 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  52.08 
 
 		 271 aa  234  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  52.08 
 
 		 271 aa  234  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  52.07 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  51.23 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  51.64 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  48.57 
 
 		 271 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.9 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  52.29 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  47.76 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  48.33 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  47.18 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  49.38 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  45.38 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  46.69 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  48.96 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1857  sugar ABC transporter ATPase  47.76 
 
 		 288 aa  211  7e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  47.6 
 
 		 262 aa  211  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  45.78 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  47.76 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  48.13 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  48.57 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 283 aa  208  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  51.12 
 
 		 259 aa  208  9e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  45.7 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  45.71 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.74 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  49.19 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  46.91 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  45.75 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  44.19 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  42.21 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  45.61 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  43.24 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  42.62 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  44.35 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  46.12 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  44.49 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  45.12 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  43.21 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  44.8 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  45.16 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.71 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  44 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.45 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  47.32 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  44.94 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  45.19 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>