More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2943 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  91.06 
 
 
246 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  89.43 
 
 
246 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 
261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  49.59 
 
 
263 aa  238  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  50.41 
 
 
261 aa  228  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  47.56 
 
 
276 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  48.37 
 
 
260 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  47.56 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  50.62 
 
 
273 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  46.75 
 
 
247 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  47.74 
 
 
278 aa  218  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.95 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  47.95 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  48.13 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  44.58 
 
 
244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  47.13 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  48.96 
 
 
273 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  45.31 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  46.5 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  47.11 
 
 
260 aa  211  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  43.57 
 
 
249 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
254 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  47.5 
 
 
261 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  46.67 
 
 
271 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.56 
 
 
286 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  46.59 
 
 
254 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  43.9 
 
 
271 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  46.67 
 
 
271 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.53 
 
 
265 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  46.25 
 
 
313 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  45 
 
 
266 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  47.74 
 
 
269 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  46.12 
 
 
258 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  46.59 
 
 
278 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
261 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  46.09 
 
 
262 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 
260 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  43.72 
 
 
265 aa  201  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.47 
 
 
269 aa  201  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  46.67 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  46.34 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  47.08 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  44.84 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
275 aa  198  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  44.12 
 
 
261 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  44.03 
 
 
259 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  47.11 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
275 aa  197  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  45.64 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  37.66 
 
 
494 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  45.08 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  45 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  42.08 
 
 
294 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  43.9 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  43.44 
 
 
254 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  50.41 
 
 
272 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  40.42 
 
 
245 aa  194  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  44.08 
 
 
257 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  41.49 
 
 
247 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  44.86 
 
 
263 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  43.72 
 
 
259 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  44.58 
 
 
257 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 
261 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  47.92 
 
 
261 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  45.83 
 
 
252 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  44.73 
 
 
254 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.92 
 
 
503 aa  191  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 
252 aa  191  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0560  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
256 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  44.03 
 
 
276 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44.63 
 
 
261 aa  190  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
250 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.08 
 
 
255 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.17 
 
 
513 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.53 
 
 
273 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  42.31 
 
 
256 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
285 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  38.75 
 
 
507 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0717  ABC transporter related  45.93 
 
 
257 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.393334  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  40 
 
 
513 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  46.25 
 
 
266 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
259 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  39.26 
 
 
502 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  43.46 
 
 
249 aa  185  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  41.7 
 
 
268 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  42.04 
 
 
284 aa  185  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  42.44 
 
 
258 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  42.02 
 
 
260 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  39.09 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  43.1 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  39.09 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  37.5 
 
 
495 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  41.03 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.33 
 
 
512 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  42.45 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.33 
 
 
512 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  42.11 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>