More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1274 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 244 aa  487  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  65.57 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  55.69 
 
 		 259 aa  269  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  50.82 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  52.67 
 
 		 257 aa  251  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  53.91 
 
 		 257 aa  248  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  50.2 
 
 		 271 aa  248  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  49.38 
 
 		 260 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  52.24 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  52.87 
 
 		 247 aa  245  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  51.84 
 
 		 266 aa  245  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  48.57 
 
 		 261 aa  244  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 261 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  51.22 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  50.2 
 
 		 294 aa  241  7.999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  48.78 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  46.72 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  51.22 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  47.54 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  51.64 
 
 		 261 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  51.44 
 
 		 258 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  49.8 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  53.78 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  51.64 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  48.36 
 
 		 245 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  50.42 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  48.77 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  48.15 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  48.35 
 
 		 264 aa  228  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  51.88 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  47.79 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  48.79 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  47.15 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  46.72 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  46.91 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  48.99 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  47.76 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  46.96 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  49.59 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  44.9 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  45.9 
 
 		 273 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  48.19 
 
 		 265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  48.15 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  51.71 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  47.95 
 
 		 258 aa  218  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  45.78 
 
 		 260 aa  218  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  44.86 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  50 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  46.5 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  50.44 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7475  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.65 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0837674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1479  ABC transporter related  52.99 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  47.13 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  46.31 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  48.35 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.15 
 
 		 268 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  50.22 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  47.76 
 
 		 264 aa  214  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  46.72 
 
 		 262 aa  214  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.9 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  45.9 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  45.9 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  44.94 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  49.33 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  44.58 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  46 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  48.88 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  45.64 
 
 		 502 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 266 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.75 
 
 		 286 aa  211  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  43.33 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 		 278 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  46.09 
 
 		 282 aa  211  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  47.92 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  44.63 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  48.98 
 
 		 275 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  46.99 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  46.37 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  44.13 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  43.62 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  50.61 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  50.21 
 
 		 273 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.26 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  44.17 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 		 265 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0775  ABC transporter  50.21 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0591265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>