More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5022 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  65.46 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  64.08 
 
 		 260 aa  323  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  63.45 
 
 		 257 aa  321  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  67.48 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  62.04 
 
 		 260 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  66.26 
 
 		 260 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  61.63 
 
 		 260 aa  314  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  63.37 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  65.29 
 
 		 261 aa  305  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  63.89 
 
 		 261 aa  301  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  61.89 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  62.4 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  48.32 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  43.53 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 260 aa  224  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  44.76 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  45.06 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  45.71 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  47.28 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 278 aa  218  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 		 244 aa  218  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  42.91 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  46.91 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  43.09 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.49 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.49 
 
 		 271 aa  215  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  44.22 
 
 		 271 aa  214  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  45.9 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  42.86 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.41 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  44.8 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  42.5 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  43.53 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  42.02 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  44.31 
 
 		 294 aa  204  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  43.37 
 
 		 502 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.88 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  43.51 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  44.72 
 
 		 528 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  39.2 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  43.1 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  42.29 
 
 		 276 aa  198  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  41.91 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.08 
 
 		 506 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  40.32 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  43.1 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  42.86 
 
 		 508 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  41.8 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  40.16 
 
 		 517 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  40.16 
 
 		 517 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  41.2 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  39.76 
 
 		 517 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.56 
 
 		 512 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  42.56 
 
 		 512 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.25 
 
 		 517 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.24 
 
 		 496 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  41.74 
 
 		 512 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 517 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  40.83 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.8 
 
 		 502 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.39 
 
 		 507 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  41.56 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.36 
 
 		 517 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  43.7 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.9 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  40.4 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  43.7 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  39.36 
 
 		 517 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  39.36 
 
 		 517 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  47.25 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  38.74 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  39.36 
 
 		 517 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.35 
 
 		 499 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.42 
 
 		 501 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 496 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  38.33 
 
 		 496 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 		 496 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  42.92 
 
 		 519 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  42.74 
 
 		 503 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  42.8 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 		 510 aa  185  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  43.75 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.74 
 
 		 514 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  39.42 
 
 		 501 aa  185  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  38.52 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>