More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4465 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  93.85 
 
 		 260 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  93.46 
 
 		 260 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  93.46 
 
 		 261 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  83.59 
 
 		 261 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  74.39 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  73.98 
 
 		 260 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  74.8 
 
 		 260 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  70.04 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  71.54 
 
 		 263 aa  357  8e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  66.39 
 
 		 258 aa  331  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  65.29 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  64.92 
 
 		 257 aa  322  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  47.79 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  45.68 
 
 		 261 aa  228  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  45.04 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  45.04 
 
 		 271 aa  225  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  47.46 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  42.4 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  45.71 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  47.33 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  42.19 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  46.19 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  45.45 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 275 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  41.49 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  46.83 
 
 		 269 aa  215  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  45.23 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  45.93 
 
 		 517 aa  211  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  43.75 
 
 		 264 aa  211  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  39.68 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  44.67 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.49 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  45.53 
 
 		 517 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  39.83 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  43.64 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  45.7 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  45.53 
 
 		 517 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  43.62 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  43.03 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.72 
 
 		 517 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  45.12 
 
 		 517 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  45.12 
 
 		 517 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  44.21 
 
 		 502 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  45.04 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  42.86 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  44.72 
 
 		 517 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  43.57 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  46.02 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  47.39 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  45.05 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.59 
 
 		 276 aa  204  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  43.22 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  43.1 
 
 		 496 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  42.55 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  44.35 
 
 		 506 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 510 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.09 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 276 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 517 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  47.32 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.77 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  47.77 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  42.11 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.15 
 
 		 499 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  44.54 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.7 
 
 		 506 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  45.38 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  41.77 
 
 		 245 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.15 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  40.83 
 
 		 258 aa  198  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  43.75 
 
 		 518 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  41.6 
 
 		 508 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  43.15 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  41.43 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  45.61 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.7 
 
 		 517 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.7 
 
 		 506 aa  195  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  41.42 
 
 		 503 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  43.7 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  41.6 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  41.9 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 517 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 507 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.1 
 
 		 507 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.1 
 
 		 507 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.98 
 
 		 517 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.98 
 
 		 517 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>