More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0692 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  61.83 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  62.35 
 
 		 265 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  61.83 
 
 		 261 aa  298  7e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  62.35 
 
 		 265 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  61.33 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 		 252 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  60.73 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  59.75 
 
 		 262 aa  291  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  58.47 
 
 		 276 aa  288  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  62.92 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 260 aa  285  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  57.77 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  54.92 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  59 
 
 		 276 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59 
 
 		 286 aa  268  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  60.74 
 
 		 272 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  55.78 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  52.65 
 
 		 278 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  50.79 
 
 		 260 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 275 aa  238  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  53.39 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  48.13 
 
 		 265 aa  231  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  48.82 
 
 		 257 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  45.93 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  49.38 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  50.21 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  47.35 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  45.19 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  48.95 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  49.39 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1857  sugar ABC transporter ATPase  48.95 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  44.11 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  45.75 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  48.8 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  47.6 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  46.64 
 
 		 261 aa  218  6e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  47.08 
 
 		 245 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  47.6 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  44.08 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  46.91 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  46.22 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  46.77 
 
 		 313 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  45.71 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  48.33 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  45.31 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  46.84 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  42.25 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  47.28 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  42.15 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  44.3 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  42.5 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  42.5 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  45.68 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  44.35 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 248 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  42.37 
 
 		 260 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  42.45 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  42.37 
 
 		 260 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 250 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  41.95 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.68 
 
 		 507 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  42.29 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 285 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  42.28 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.51 
 
 		 494 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  41.15 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  42.04 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.13 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  40.56 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  40.49 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3688  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3423  ABC transporter related  42.64 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111863  normal  0.794902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  40.56 
 
 		 260 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.83 
 
 		 501 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  39.92 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6162  ABC transporter related  43.85 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  42.91 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  41.46 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  42.62 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  41.7 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  41.32 
 
 		 502 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 		 510 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  40.56 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  39.85 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  40 
 
 		 513 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  41.25 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>