More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6227 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  89.96 
 
 		 264 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  76.64 
 
 		 261 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  72.8 
 
 		 257 aa  348  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  61.51 
 
 		 266 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  44.67 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  44.21 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  42.68 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 247 aa  198  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  43.22 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  45.76 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  44.83 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  43.59 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  45.85 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  42.55 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  44.68 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  42.24 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  42.45 
 
 		 244 aa  188  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  46.05 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  42.31 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  40.62 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  44.98 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  43.69 
 
 		 284 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  40.83 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  42.06 
 
 		 274 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  41.45 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  48.39 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  42.98 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7024  ABC transporter related  46.46 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  41.85 
 
 		 315 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  42.92 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  39.53 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  41.41 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  45.74 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  42.74 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  45.74 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  42.34 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  42.42 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  42.11 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  44.14 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.08 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  42.36 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  40.93 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  42.79 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  46.33 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  45.29 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  39.74 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.29 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.5 
 
 		 276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  42.62 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  36.71 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  41.08 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  40.35 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.24 
 
 		 288 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  42.28 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  42.08 
 
 		 278 aa  178  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  43.12 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  40.16 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.78 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  43.4 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  43.95 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  41.99 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  42.15 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  43.95 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  41.22 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  44.35 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  41.53 
 
 		 288 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 		 278 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  45.74 
 
 		 258 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  39.02 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.12 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  44.39 
 
 		 268 aa  174  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  42.66 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  44.84 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  43.24 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0538  ABC transporter related  43.24 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  40.39 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  41.99 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  41.84 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  38.1 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  44.59 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  43.62 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  40.16 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  42.55 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>