More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4052 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  69.41 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  70.12 
 
 		 274 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  68.25 
 
 		 271 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  65.38 
 
 		 267 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  65.15 
 
 		 305 aa  358  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  66.53 
 
 		 289 aa  353  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  64.62 
 
 		 269 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  65.88 
 
 		 315 aa  352  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  65.74 
 
 		 274 aa  342  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  64.45 
 
 		 274 aa  341  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  64.9 
 
 		 258 aa  328  7e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  61.51 
 
 		 260 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  58.48 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  58.59 
 
 		 262 aa  314  9e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  62.15 
 
 		 255 aa  313  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  60.58 
 
 		 294 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  56.52 
 
 		 266 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  55 
 
 		 264 aa  291  9e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.97 
 
 		 259 aa  289  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  54.83 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  56.97 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.17 
 
 		 266 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  53.91 
 
 		 266 aa  284  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  55.34 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  55.6 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  54.98 
 
 		 265 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  54.18 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  53.78 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.16 
 
 		 278 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.02 
 
 		 266 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.02 
 
 		 266 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  55.16 
 
 		 288 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.02 
 
 		 266 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.02 
 
 		 266 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.02 
 
 		 266 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.02 
 
 		 266 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.02 
 
 		 266 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  50.57 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  50.39 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  47.69 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  47.88 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  42.91 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 260 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6227  ABC transporter related  43.22 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  44.03 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.8 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  42.11 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  46.7 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  40 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1148  ABC transporter related  42.24 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  41.47 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  40.5 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  41.47 
 
 		 269 aa  185  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  42.8 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  42.98 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  42.08 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  41.6 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  42.56 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  40.93 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  42.47 
 
 		 272 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  44.93 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  41.56 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  39.41 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  42.91 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.95 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  40.53 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  41.63 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.04 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  40.81 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0915  ABC transporter related  39 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  38.61 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  46.98 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0353  ABC transporter related  40.68 
 
 		 302 aa  178  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 278 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.95 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  40.64 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.61 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  38.41 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  39.46 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  40.76 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  43.69 
 
 		 257 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  37.65 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  41.1 
 
 		 245 aa  176  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  43.17 
 
 		 264 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  38.15 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  37.18 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  40.5 
 
 		 313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  41.6 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.04 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3623  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>