More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4482 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  67.82 
 
 
506 aa  679    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  99 
 
 
500 aa  1002    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  99 
 
 
500 aa  999    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  99.2 
 
 
500 aa  1000    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  61.94 
 
 
507 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
500 aa  1012    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  66.4 
 
 
503 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  99 
 
 
500 aa  999    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  86.32 
 
 
501 aa  877    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  67.62 
 
 
506 aa  681    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  67.21 
 
 
496 aa  688    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  67.21 
 
 
496 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  99.2 
 
 
500 aa  1001    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  62.55 
 
 
507 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  88 
 
 
500 aa  889    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  67.41 
 
 
496 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  94 
 
 
500 aa  956    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
500 aa  1012    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  60.57 
 
 
505 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 
516 aa  588  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  57.03 
 
 
515 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  55.4 
 
 
512 aa  548  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  52.63 
 
 
499 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  52.5 
 
 
510 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  52.83 
 
 
500 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  52.83 
 
 
499 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  52.6 
 
 
499 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 
501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  52.63 
 
 
499 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  53.32 
 
 
504 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  51.7 
 
 
523 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
503 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  50.9 
 
 
525 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  50.9 
 
 
525 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  50.9 
 
 
526 aa  480  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  50 
 
 
507 aa  480  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  50.5 
 
 
504 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  50.5 
 
 
504 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  50.5 
 
 
504 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  51.72 
 
 
505 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  51.43 
 
 
503 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  51.59 
 
 
516 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  50.3 
 
 
549 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  51.43 
 
 
504 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  51.22 
 
 
504 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  47.95 
 
 
513 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.89 
 
 
522 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  49.8 
 
 
506 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  51.45 
 
 
511 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  50.7 
 
 
502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  45.31 
 
 
544 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 
508 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  46.34 
 
 
497 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.82 
 
 
544 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  48.58 
 
 
519 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.13 
 
 
501 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.18 
 
 
499 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  42.83 
 
 
585 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  43.12 
 
 
502 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.4 
 
 
504 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
526 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.54 
 
 
518 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
497 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  41.16 
 
 
500 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  42.21 
 
 
496 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
525 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.48 
 
 
514 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 
496 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  41.68 
 
 
513 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  41.52 
 
 
513 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
496 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.01 
 
 
506 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.4 
 
 
512 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  41.19 
 
 
513 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.4 
 
 
512 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.09 
 
 
507 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.07 
 
 
512 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  41.7 
 
 
495 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.2 
 
 
501 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  38.09 
 
 
498 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  43.61 
 
 
509 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  43.61 
 
 
504 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  41.34 
 
 
512 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
504 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  43.6 
 
 
506 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  44.51 
 
 
497 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 
523 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.97 
 
 
520 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.39 
 
 
497 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 
505 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.48 
 
 
519 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  42.89 
 
 
501 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  39.96 
 
 
516 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  40.32 
 
 
525 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  41.63 
 
 
509 aa  375  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  41.26 
 
 
524 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.51 
 
 
495 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  42.62 
 
 
506 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>