More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2408 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  83.78 
 
 		 266 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  76.15 
 
 		 266 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  76.15 
 
 		 262 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  75.78 
 
 		 264 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  68.7 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  69.14 
 
 		 259 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  67.97 
 
 		 259 aa  363  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  66.04 
 
 		 266 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  64.48 
 
 		 282 aa  345  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  63.39 
 
 		 262 aa  341  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  60.48 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  55.12 
 
 		 265 aa  319  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  56.69 
 
 		 264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.72 
 
 		 266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.72 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.72 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.51 
 
 		 278 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  52.71 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  61.13 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  59.76 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  59.36 
 
 		 260 aa  294  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  51.35 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  54.18 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  54.37 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  55.16 
 
 		 289 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  53.39 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  53.01 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  57.2 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  53.17 
 
 		 271 aa  268  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  54.15 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  55.51 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  50.39 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  50.78 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  51.19 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  51.59 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  46.53 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  47.52 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  42.64 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  42.11 
 
 		 249 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  45.12 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  42.86 
 
 		 260 aa  198  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  44.98 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.56 
 
 		 265 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  43.56 
 
 		 265 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  44.49 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  40.74 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  40.25 
 
 		 243 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  42.08 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  41.13 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  43.42 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.61 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 517 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  39.38 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  40.42 
 
 		 521 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  41.02 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  41.85 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  38.31 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  39.36 
 
 		 260 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  39.38 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  43.3 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.17 
 
 		 516 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  37.45 
 
 		 524 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  38.78 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  37.96 
 
 		 524 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  37.45 
 
 		 524 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  38.62 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  37.96 
 
 		 524 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  41.98 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  37.04 
 
 		 524 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  44.16 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 		 518 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  38.89 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  39.76 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  42.53 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  40.09 
 
 		 263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  43.61 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 		 517 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 		 517 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 		 517 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3205  ABC transporter related  44.69 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00011421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  41.92 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  40.16 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.19 
 
 		 527 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.62 
 
 		 500 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0914  ABC transporter related  40.98 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>