More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4535 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  85.93 
 
 		 271 aa  474  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  70.12 
 
 		 282 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  65.25 
 
 		 267 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  70.24 
 
 		 289 aa  355  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  67.45 
 
 		 269 aa  346  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  62.41 
 
 		 305 aa  345  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  66.8 
 
 		 274 aa  338  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  65.37 
 
 		 274 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  60.67 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  64.94 
 
 		 258 aa  333  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  62.31 
 
 		 267 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  64.06 
 
 		 255 aa  326  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  60.63 
 
 		 260 aa  315  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  59.13 
 
 		 301 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  62.14 
 
 		 294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  58.73 
 
 		 316 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  55.29 
 
 		 282 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 259 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  55.56 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  55.95 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  53.94 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  53.31 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  53.73 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  54.86 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  51.95 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  51.94 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  50.39 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  50.57 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 		 266 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.16 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  50 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.34 
 
 		 278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  50.59 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  49.04 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  49.02 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  44.31 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  41.39 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  40.57 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5243  ABC transporter related  42.44 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  42.92 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2514  ABC transporter-like protein  40.53 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.703565  normal  0.280675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  44.96 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  41.15 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.19 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  43.31 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  42.04 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 		 271 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  38.98 
 
 		 260 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 250 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  41.3 
 
 		 265 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  40 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  39.85 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  39.51 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  40.16 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3352  ABC transporter related  40.84 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  41.67 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  42.98 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  41.56 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  42.86 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  41.42 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  43.37 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  42.62 
 
 		 264 aa  186  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  41.53 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  41.18 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  42.15 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2855  ABC transporter-related protein  39.47 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  42.34 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  43.67 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  41.3 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  42.26 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  40.08 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  41.67 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  40.4 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  41.88 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  40.47 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3556  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301945  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  41.43 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  41.32 
 
 		 244 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2605  ABC transporter related  42.31 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  38.96 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  39.46 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>