More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1857 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1857  sugar ABC transporter ATPase  100 
 
 
288 aa  584  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  52.07 
 
 
276 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2516  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  49.6 
 
 
262 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  51.48 
 
 
263 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  52.3 
 
 
277 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  51.64 
 
 
276 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  48.95 
 
 
271 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.23 
 
 
288 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  48.95 
 
 
261 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  49.39 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.23 
 
 
286 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.46 
 
 
265 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  51.46 
 
 
265 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0750  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
260 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  47.76 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  48.35 
 
 
265 aa  208  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
252 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  45.56 
 
 
265 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  45.68 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  42.69 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  45.53 
 
 
260 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  43.51 
 
 
246 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  44.58 
 
 
252 aa  191  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
247 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  42.56 
 
 
244 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6092  ABC transporter related  38.55 
 
 
253 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5186  ABC transporter related  47.3 
 
 
272 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111705  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  44 
 
 
261 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  38.98 
 
 
261 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  40.59 
 
 
246 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  42.06 
 
 
257 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  41.42 
 
 
247 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  38.21 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
254 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  44.02 
 
 
269 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 
275 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  39.24 
 
 
257 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  40.24 
 
 
254 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  37.71 
 
 
248 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  41.53 
 
 
271 aa  178  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  41.95 
 
 
271 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  38.59 
 
 
258 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  39.76 
 
 
254 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  41.6 
 
 
261 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
269 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  44.16 
 
 
261 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  41.1 
 
 
257 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  41.18 
 
 
264 aa  175  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  37.29 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  37.19 
 
 
260 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  38.06 
 
 
271 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  37.19 
 
 
260 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0150  ABC transporter related  38.04 
 
 
517 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995169  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.43 
 
 
496 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  36.78 
 
 
260 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2715  sugar (ribose) ABC transporter ATP-binding protein  40.42 
 
 
261 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0375081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  43.11 
 
 
261 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0147  ABC transporter related  40.17 
 
 
294 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4465  ABC transporter related  39.41 
 
 
261 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2600  ABC transporter related  37.66 
 
 
257 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3228  ABC transporter related  38.37 
 
 
517 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  39.41 
 
 
261 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3187  ABC transporter related  39.41 
 
 
260 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0156  ABC transporter related  37.25 
 
 
517 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000343593  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  40.51 
 
 
255 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2927  ABC transporter related  38.98 
 
 
260 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3269  ABC transporter related  39.34 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.704412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  33.46 
 
 
501 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  38.08 
 
 
266 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  36.4 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  40.34 
 
 
283 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35 
 
 
515 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40 
 
 
522 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  42.08 
 
 
259 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  40.65 
 
 
245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  35.91 
 
 
503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  37.7 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5304  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.64898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  38.4 
 
 
313 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0100  xylose transporter ATP-binding subunit  37.24 
 
 
513 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  42.17 
 
 
257 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  39.75 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  37.08 
 
 
497 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  37.5 
 
 
506 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  36.51 
 
 
494 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  38.4 
 
 
257 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 
515 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.01 
 
 
515 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3409  ABC transporter related  37.61 
 
 
508 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  37.61 
 
 
508 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  39.08 
 
 
505 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 
496 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  36.07 
 
 
496 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
496 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  33.7 
 
 
503 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>