More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1595 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2133  ABC transporter related protein  98.43 
 
 
511 aa  1021    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0375585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2126  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  97.85 
 
 
511 aa  1014    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1595  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  100 
 
 
511 aa  1038    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4320  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 
511 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4472  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 
511 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3521  autoinducer AI-2 ABC transporter, ATP binding protein  66 
 
 
527 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3650  ABC transporter related  66 
 
 
527 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4405  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 
511 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365646  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2145  ABC transporter related  99.8 
 
 
511 aa  1035    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1659  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  98.04 
 
 
511 aa  1018    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.935771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4290  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 
511 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293045  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1714  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  99.05 
 
 
333 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0858  autoinducer AI-2 ABC transporter ATP binding protein  66 
 
 
527 aa  659    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4402  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 
511 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0051  ABC transporter, ATP-binding, sugar transport  62.48 
 
 
502 aa  629  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000186076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3536  ABC transporter related  61.38 
 
 
495 aa  586  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3149  ABC transporter related  47.85 
 
 
491 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180816  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3503  sugar ABC transporter ATPase  47.44 
 
 
491 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3015  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.56 
 
 
493 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0481734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2716  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 
493 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2263  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.04 
 
 
493 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2772  ABC transporter related  40.04 
 
 
497 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0913343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2975  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.99 
 
 
493 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000730474 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2696  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 
493 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3017  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 
493 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2766  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.26 
 
 
496 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2978  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.26 
 
 
496 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2979  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 
493 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.17 
 
 
495 aa  340  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.49 
 
 
506 aa  339  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40.43 
 
 
519 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.13 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
497 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.49 
 
 
492 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 
501 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.37 
 
 
499 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.94 
 
 
501 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  38.37 
 
 
513 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  38.98 
 
 
503 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.76 
 
 
496 aa  324  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.26 
 
 
517 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  39.84 
 
 
503 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.46 
 
 
506 aa  323  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.49 
 
 
503 aa  323  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  38.02 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.88 
 
 
504 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  38.79 
 
 
512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  37.57 
 
 
501 aa  319  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 
507 aa  319  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
492 aa  319  9e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  39.02 
 
 
507 aa  319  9e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.82 
 
 
507 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  37.5 
 
 
513 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  38.98 
 
 
495 aa  319  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  37.45 
 
 
501 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.66 
 
 
501 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  38.66 
 
 
501 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  37.23 
 
 
501 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  38.66 
 
 
501 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  38.86 
 
 
501 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  38.45 
 
 
500 aa  318  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 
541 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
501 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  38.66 
 
 
501 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  38.66 
 
 
501 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  37.6 
 
 
504 aa  316  5e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  38.2 
 
 
511 aa  316  8e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  37.2 
 
 
510 aa  316  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  38.37 
 
 
506 aa  316  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  38.46 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  38.46 
 
 
501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  38.46 
 
 
501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  38.84 
 
 
501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  37.83 
 
 
487 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  39.04 
 
 
507 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  37.3 
 
 
512 aa  312  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03959  fused D-allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.31 
 
 
510 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3904  ABC transporter related protein  36.31 
 
 
510 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03919  hypothetical protein  36.31 
 
 
510 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.6 
 
 
512 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  38.28 
 
 
509 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3939  D-allose transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 
510 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.650182  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4553  D-allose transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 
510 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  36.94 
 
 
512 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  40.55 
 
 
498 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
494 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  36.96 
 
 
516 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  39.37 
 
 
508 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  39.18 
 
 
501 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.65 
 
 
503 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  37.55 
 
 
508 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.99 
 
 
516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  36.65 
 
 
505 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  38.35 
 
 
518 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  38.07 
 
 
516 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  38.07 
 
 
516 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  38.07 
 
 
516 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  37.57 
 
 
501 aa  310  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  38.07 
 
 
501 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  38.07 
 
 
516 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>