More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4320 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0858  autoinducer AI-2 ABC transporter ATP binding protein  66.8 
 
 
527 aa  677    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2133  ABC transporter related protein  75.15 
 
 
511 aa  780    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0375585  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4472  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  100 
 
 
511 aa  1046    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1659  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  75.15 
 
 
511 aa  780    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.935771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3521  autoinducer AI-2 ABC transporter, ATP binding protein  67.47 
 
 
527 aa  683    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4320  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  100 
 
 
511 aa  1046    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3650  ABC transporter related  67.47 
 
 
527 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4405  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  99.8 
 
 
511 aa  1045    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365646  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4290  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  100 
 
 
511 aa  1046    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293045  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2126  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  74.95 
 
 
511 aa  778    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2145  ABC transporter related  75.34 
 
 
511 aa  785    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1595  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  75.15 
 
 
511 aa  782    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4402  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  100 
 
 
511 aa  1046    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0051  ABC transporter, ATP-binding, sugar transport  60.88 
 
 
502 aa  615  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000186076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3536  ABC transporter related  59.55 
 
 
495 aa  568  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1714  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  74.12 
 
 
333 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3149  ABC transporter related  47.55 
 
 
491 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180816  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3503  sugar ABC transporter ATPase  47.14 
 
 
491 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3015  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.51 
 
 
493 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0481734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2263  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.03 
 
 
493 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2716  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.23 
 
 
493 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2975  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
493 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000730474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3017  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
493 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2696  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.23 
 
 
493 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2979  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
493 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2772  ABC transporter related  37.55 
 
 
497 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0913343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2766  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 
496 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2978  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 
496 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.76 
 
 
503 aa  356  6.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.29 
 
 
495 aa  342  7e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.22 
 
 
506 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.81 
 
 
492 aa  340  5e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
501 aa  336  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
494 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  38.1 
 
 
496 aa  335  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.04 
 
 
519 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
494 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.08 
 
 
501 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.58 
 
 
517 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
497 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  37.92 
 
 
499 aa  333  6e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 
494 aa  333  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 
508 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  35.62 
 
 
505 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  38.63 
 
 
503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  38.46 
 
 
511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  36.96 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 
525 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.63 
 
 
506 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  36.89 
 
 
512 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40 
 
 
512 aa  326  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  36.74 
 
 
510 aa  326  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  36.79 
 
 
513 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.33 
 
 
504 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 
498 aa  324  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  37.68 
 
 
510 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  38.9 
 
 
524 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  38.9 
 
 
524 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  38.24 
 
 
508 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  38.13 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  37.43 
 
 
499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
527 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  34.66 
 
 
493 aa  320  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  37.67 
 
 
499 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  37.6 
 
 
525 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  36.47 
 
 
500 aa  320  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  38.57 
 
 
524 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.16 
 
 
516 aa  319  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  36.35 
 
 
513 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  38.57 
 
 
507 aa  319  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  40.08 
 
 
487 aa  319  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  38.34 
 
 
495 aa  319  9e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  38.35 
 
 
494 aa  319  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.37 
 
 
507 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.51 
 
 
503 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  37.96 
 
 
521 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  39.15 
 
 
524 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  37.3 
 
 
501 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  39.15 
 
 
524 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  38.05 
 
 
495 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5197  ABC transporter related  37.16 
 
 
540 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 
492 aa  317  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  38.19 
 
 
524 aa  317  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  36.78 
 
 
501 aa  317  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  36.54 
 
 
500 aa  317  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  38.4 
 
 
514 aa  316  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  37.11 
 
 
501 aa  316  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.52 
 
 
521 aa  316  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.68 
 
 
513 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  35.77 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  37.57 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  38.37 
 
 
515 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>