More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1659 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2133  ABC transporter related protein  98.24 
 
 		 511 aa  1018    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0375585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1595  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  98.04 
 
 		 511 aa  1018    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2126  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  97.46 
 
 		 511 aa  1011    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4472  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 		 511 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1659  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  100 
 
 		 511 aa  1035    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4320  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 		 511 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2145  ABC transporter related  98.24 
 
 		 511 aa  1020    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3650  ABC transporter related  66.2 
 
 		 527 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4290  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 		 511 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3521  autoinducer AI-2 ABC transporter, ATP binding protein  66.2 
 
 		 527 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0858  autoinducer AI-2 ABC transporter ATP binding protein  66.2 
 
 		 527 aa  658    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4402  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 		 511 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4405  putative ABC transporter ATP-binding protein ego  75.15 
 
 		 511 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1714  autoinducer-2 ABC transporter, ATP-binding protein LsrA  97.16 
 
 		 333 aa  626  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0051  ABC transporter, ATP-binding, sugar transport  62.28 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000186076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3536  ABC transporter related  61.38 
 
 		 495 aa  584  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3149  ABC transporter related  48.26 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180816  normal  0.205062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3503  sugar ABC transporter ATPase  47.85 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3015  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.36 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0481734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2716  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2263  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2975  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000730474 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2696  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3017  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2772  ABC transporter related  40.04 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0913343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2766  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2978  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 496 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2979  putative ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.63 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.72 
 
 		 503 aa  343  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  39.69 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.37 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.89 
 
 		 492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.77 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40.04 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  39.76 
 
 		 503 aa  329  6e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.85 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.94 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.18 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.75 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 492 aa  323  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.46 
 
 		 506 aa  323  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  39.25 
 
 		 501 aa  323  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  37.98 
 
 		 513 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.57 
 
 		 512 aa  323  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  37.77 
 
 		 501 aa  322  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.05 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  39.05 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  39.05 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  39.05 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  39.05 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  37.65 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  37.99 
 
 		 504 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  39.48 
 
 		 503 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.49 
 
 		 495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.69 
 
 		 503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  37.43 
 
 		 501 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.9 
 
 		 507 aa  320  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.08 
 
 		 504 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 		 510 aa  320  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  38.86 
 
 		 501 aa  320  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  38.9 
 
 		 507 aa  319  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  38.65 
 
 		 500 aa  319  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  38.86 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.7 
 
 		 507 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  38.04 
 
 		 487 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  38.4 
 
 		 511 aa  317  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  38.02 
 
 		 499 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  38.57 
 
 		 506 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.05 
 
 		 501 aa  316  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  39.18 
 
 		 518 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  38.97 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  38.26 
 
 		 516 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  38.26 
 
 		 516 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  39.24 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03959  fused D-allose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.5 
 
 		 510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3904  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  37.14 
 
 		 512 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  38.26 
 
 		 516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03919  hypothetical protein  36.5 
 
 		 510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  38.26 
 
 		 516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  38.46 
 
 		 501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  38.26 
 
 		 501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4553  D-allose transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 		 510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3939  D-allose transporter ATP-binding protein  36.5 
 
 		 510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.650182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  37.94 
 
 		 508 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  39.13 
 
 		 524 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  37.12 
 
 		 513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.77 
 
 		 501 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  37.72 
 
 		 512 aa  313  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  39.05 
 
 		 501 aa  312  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 541 aa  312  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  37.77 
 
 		 501 aa  312  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  40.34 
 
 		 498 aa  312  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  39.84 
 
 		 516 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 		 508 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  39.54 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  38.92 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>