More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1905 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1905  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 493 aa  989    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  36.75 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  35.19 
 
 		 509 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 476 aa  256  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  36.36 
 
 		 477 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.84 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 496 aa  153  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 475 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.06 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  31.17 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 560 aa  150  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.26 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  28.22 
 
 		 490 aa  123  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  27.5 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  32.28 
 
 		 478 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.23 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  26.45 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 468 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  29.11 
 
 		 521 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  25.83 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 424 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 452 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 513 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1774  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 488 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  31.65 
 
 		 514 aa  93.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  28.75 
 
 		 482 aa  91.3  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 439 aa  91.3  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3302  histidine kinase  26.7 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 700 aa  90.1  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 691 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3467  putative signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 446 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.548069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  30.67 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  30.87 
 
 		 525 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.19 
 
 		 466 aa  88.6  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  31.96 
 
 		 447 aa  88.6  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 412 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  28.77 
 
 		 453 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 468 aa  86.7  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  32.74 
 
 		 459 aa  86.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 594 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  30.88 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 671 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  30.2 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  30.52 
 
 		 619 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  29.72 
 
 		 680 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 654 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  29.28 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.36 
 
 		 683 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  30.54 
 
 		 594 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  29.28 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  30.23 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  29.72 
 
 		 680 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  29.28 
 
 		 509 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  29.73 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  28.96 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  28.45 
 
 		 710 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  28.45 
 
 		 710 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  27.82 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  32.23 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  29.78 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0727  putative signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 594 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  24.37 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 364 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  30.77 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  29.48 
 
 		 687 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  29.96 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3849  histidine kinase  30.43 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  29.15 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  30.22 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  28.8 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  29.91 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>