More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1029 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  100 
 
 
462 aa  908    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  46.04 
 
 
468 aa  323  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  32.82 
 
 
475 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  34.95 
 
 
459 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  31.64 
 
 
490 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.71 
 
 
466 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  37.24 
 
 
486 aa  157  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  28.25 
 
 
439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.74 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  35.9 
 
 
478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
560 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
493 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  32.96 
 
 
452 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.25 
 
 
479 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
573 aa  123  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  33.14 
 
 
477 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  32.77 
 
 
509 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  30.41 
 
 
509 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1905  putative signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
493 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0907492  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
471 aa  113  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  33.48 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  33.48 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  33.04 
 
 
509 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
496 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
446 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  36.24 
 
 
513 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
506 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  29.96 
 
 
489 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
692 aa  103  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
424 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  21.72 
 
 
447 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
421 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3849  histidine kinase  33.22 
 
 
497 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  26.47 
 
 
482 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  33.49 
 
 
514 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  27.67 
 
 
497 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
682 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
425 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
473 aa  96.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
385 aa  96.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  32.41 
 
 
799 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
799 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.87 
 
 
683 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  31.65 
 
 
463 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  31.65 
 
 
463 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  33.91 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  33.91 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  33.91 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  33.91 
 
 
492 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  34.27 
 
 
458 aa  94  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
513 aa  94  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
489 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
395 aa  93.2  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
439 aa  93.2  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.63 
 
 
466 aa  93.2  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
376 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  31.82 
 
 
525 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  31.64 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
490 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.48 
 
 
797 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  30.41 
 
 
1046 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  30.27 
 
 
351 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  29.89 
 
 
351 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
684 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  33.04 
 
 
687 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  32.41 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
748 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
366 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  35.53 
 
 
1809 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  33.33 
 
 
505 aa  90.9  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  29.89 
 
 
351 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  32.3 
 
 
488 aa  90.9  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  31.07 
 
 
453 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
424 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
1168 aa  90.5  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
801 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
707 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  30.27 
 
 
351 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  32.4 
 
 
446 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  30.27 
 
 
351 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  34.36 
 
 
338 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
541 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  31.78 
 
 
493 aa  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.56 
 
 
456 aa  89.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 
490 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  29.89 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  32.72 
 
 
670 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
795 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
703 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
771 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
546 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>