More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1786 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  100 
 
 
479 aa  952    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2604  signal transduction histidine kinase glucose-6-phosphate-like protein  40.4 
 
 
495 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3849  histidine kinase  38.78 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.63 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  33.53 
 
 
490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  31.19 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.35 
 
 
448 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.96 
 
 
486 aa  123  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  36.24 
 
 
478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  38.26 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
476 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
453 aa  118  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.79 
 
 
489 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  32.36 
 
 
488 aa  117  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
472 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.71 
 
 
462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  30.27 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  32.74 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  34.28 
 
 
452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
506 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
493 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
496 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
421 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  32.87 
 
 
509 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  32.87 
 
 
509 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
560 aa  107  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
424 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
473 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  33.11 
 
 
459 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
334 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
425 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  31.2 
 
 
521 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  28.21 
 
 
482 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  32.7 
 
 
475 aa  100  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.06 
 
 
466 aa  100  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  34.6 
 
 
468 aa  99.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  35.77 
 
 
368 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
552 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
700 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
700 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
541 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
476 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
700 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
573 aa  97.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  34.97 
 
 
594 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.91 
 
 
373 aa  96.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
684 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
707 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
771 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
594 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
594 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  31.63 
 
 
451 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  30.71 
 
 
497 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  30.28 
 
 
488 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  31.74 
 
 
527 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.7 
 
 
456 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  30.3 
 
 
509 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  30.3 
 
 
509 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
703 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  31.71 
 
 
356 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
424 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  30.3 
 
 
509 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  32.35 
 
 
464 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
446 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
336 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  34.56 
 
 
772 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
513 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
480 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
775 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
446 aa  91.3  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  36.76 
 
 
338 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  31.93 
 
 
296 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
489 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
703 aa  90.1  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
475 aa  90.1  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  30.2 
 
 
1046 aa  90.1  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  31.89 
 
 
518 aa  90.1  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  31.37 
 
 
619 aa  90.1  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
485 aa  90.1  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
376 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
376 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  31.37 
 
 
680 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  30.26 
 
 
680 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
378 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3302  histidine kinase  28.57 
 
 
455 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
770 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
644 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  31.5 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.41 
 
 
325 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
447 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
468 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
384 aa  88.2  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.15 
 
 
388 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
541 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>