More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3092 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  97.17 
 
 
424 aa  815    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  92.45 
 
 
424 aa  732    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
425 aa  842    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 
421 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  54.9 
 
 
216 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.33 
 
 
466 aa  147  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
560 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  30.67 
 
 
439 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.21 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
496 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  34.91 
 
 
488 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
468 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  36.89 
 
 
466 aa  124  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.77 
 
 
448 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  33.17 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  29.44 
 
 
521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
453 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  36.02 
 
 
683 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  28.32 
 
 
447 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
541 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
473 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  29.11 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  32.26 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  31.4 
 
 
477 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  32.37 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  33.08 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
541 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  33.48 
 
 
395 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
526 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
553 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
801 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  29.36 
 
 
490 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
471 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  30.26 
 
 
468 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  33.91 
 
 
514 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
795 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  33.01 
 
 
463 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  33.01 
 
 
463 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  33.01 
 
 
492 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
492 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
552 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  33.01 
 
 
492 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  33.01 
 
 
492 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  33.01 
 
 
492 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
462 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
462 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
513 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  34.45 
 
 
338 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
412 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
493 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  32.28 
 
 
489 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  32.69 
 
 
463 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
573 aa  106  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  37.11 
 
 
1809 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
546 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
795 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.86 
 
 
479 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
476 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
661 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
795 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  31.29 
 
 
368 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6033  histidine kinase  29.07 
 
 
726 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.579668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2604  signal transduction histidine kinase glucose-6-phosphate-like protein  33.67 
 
 
495 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 
795 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 
518 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
770 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
366 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
472 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
372 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  32.56 
 
 
458 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
654 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
1168 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  34.31 
 
 
474 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  32.64 
 
 
249 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  34.84 
 
 
689 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
461 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  30.3 
 
 
515 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  31.47 
 
 
462 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
346 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
485 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  31.25 
 
 
687 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  33.03 
 
 
513 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
748 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  34.81 
 
 
650 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2419  histidine kinase  37.6 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.437374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  33.99 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.88 
 
 
456 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  27.83 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
439 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  31.06 
 
 
619 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
521 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  31.4 
 
 
459 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
474 aa  97.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
671 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
475 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.27 
 
 
456 aa  97.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  31.06 
 
 
680 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  36.17 
 
 
387 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  31.06 
 
 
680 aa  97.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>