More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3593 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3593  histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  846    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  95.74 
 
 		 446 aa  760    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3467  putative signal transduction histidine kinase  80.72 
 
 		 446 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.548069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.14 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  54.21 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  40.92 
 
 		 478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  36.87 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 468 aa  172  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  34.57 
 
 		 521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  31.09 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.32 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.34 
 
 		 486 aa  126  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  32.63 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  28.66 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.43 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.06 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.5 
 
 		 462 aa  99.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 560 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  32.7 
 
 		 488 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 493 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 496 aa  97.1  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.46 
 
 		 479 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  30.89 
 
 		 509 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  30.68 
 
 		 509 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  32.86 
 
 		 323 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  32.72 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 506 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  33.63 
 
 		 296 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  33.63 
 
 		 298 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1905  putative signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 493 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  27.97 
 
 		 475 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 298 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  32.61 
 
 		 710 aa  87.8  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  32.61 
 
 		 710 aa  87.8  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  36.57 
 
 		 464 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.6 
 
 		 325 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1560  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 569 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  32.7 
 
 		 313 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 476 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  30.53 
 
 		 1739 aa  86.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  32.4 
 
 		 783 aa  86.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 421 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4861  histidine kinase  34.62 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.164786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3849  histidine kinase  33.8 
 
 		 497 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  30.99 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 671 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  33.91 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  31.06 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3302  histidine kinase  28.86 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  35.98 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1114  histidine kinase  32.49 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0404541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  30.31 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  29.81 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  23.55 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  31.11 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  31.53 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  26.32 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3085  putative two component signal transduction protein  30.27 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  28.31 
 
 		 638 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 700 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  23.87 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  23.87 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  30.17 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 770 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3782  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  31.14 
 
 		 772 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  23.56 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  23.56 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  23.56 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  23.56 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3503  sensory histidine kinase UhpB  29.96 
 
 		 505 aa  79.7  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  23.56 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 468 aa  79.7  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  30.18 
 
 		 1101 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 795 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 345 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 1226 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 799 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  26.74 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 795 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 462 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>