More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1560 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1560  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 569 aa  1159    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2683  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.22 
 
 		 1023 aa  178  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000849371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3442  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 646 aa  173  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  30.87 
 
 		 532 aa  148  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2463  diguanylate cyclase  35.21 
 
 		 637 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.18 
 
 		 1052 aa  123  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.697707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 484 aa  117  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 795 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  33.66 
 
 		 671 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  36.04 
 
 		 710 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  36.04 
 
 		 710 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  37.31 
 
 		 282 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  33.64 
 
 		 592 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  35.37 
 
 		 356 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 344 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 526 aa  110  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 795 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 799 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 795 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  37.44 
 
 		 309 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.5 
 
 		 799 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  38.19 
 
 		 325 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  32.68 
 
 		 670 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.02 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 748 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 450 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  33 
 
 		 223 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  33.08 
 
 		 1101 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 		 795 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.64 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  32.77 
 
 		 653 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  33 
 
 		 797 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  31.79 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2092  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 841 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0705515  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  34.58 
 
 		 351 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  31.84 
 
 		 598 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 665 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  31.75 
 
 		 249 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 700 aa  104  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 707 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 595 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 598 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  27.76 
 
 		 391 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 684 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 351 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 700 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 700 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  30.69 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  34.5 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  27.09 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 347 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 596 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  37.56 
 
 		 338 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  36.1 
 
 		 404 aa  103  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 703 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 508 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4713  histidine kinase  36.1 
 
 		 404 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.739692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 594 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  30.99 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.19 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 1229 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  33.33 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 692 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  33.47 
 
 		 1226 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  33.5 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  30.18 
 
 		 664 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 447 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  32.32 
 
 		 687 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2032  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 609 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.509946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 381 aa  100  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 381 aa  100  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 671 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 703 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>