More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6033 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6033  histidine kinase  100 
 
 		 726 aa  1495    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  28.52 
 
 		 657 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  42.73 
 
 		 600 aa  178  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  39.27 
 
 		 636 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 		 730 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  24.58 
 
 		 653 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  23.8 
 
 		 643 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 606 aa  125  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  33.33 
 
 		 246 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  32.11 
 
 		 738 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  28.72 
 
 		 287 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.37 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5914  histidine kinase  34 
 
 		 288 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0349357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  26.9 
 
 		 592 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  25.2 
 
 		 687 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  33.01 
 
 		 616 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  22.06 
 
 		 645 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 425 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  30.95 
 
 		 645 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  30.08 
 
 		 638 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  30.77 
 
 		 525 aa  97.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 661 aa  95.1  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  32.49 
 
 		 664 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5475  histidine kinase  33.5 
 
 		 267 aa  94.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 594 aa  94.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  31.1 
 
 		 670 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 573 aa  92.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  31.63 
 
 		 594 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  30.14 
 
 		 270 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 378 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 513 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.74 
 
 		 466 aa  91.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 603 aa  91.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 513 aa  91.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 564 aa  90.9  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  31.96 
 
 		 1024 aa  90.5  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 421 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  32.83 
 
 		 659 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  31.68 
 
 		 223 aa  89  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  25.55 
 
 		 668 aa  89  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 682 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 594 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  29.2 
 
 		 298 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 556 aa  88.2  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 466 aa  87.4  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 466 aa  87.4  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30.48 
 
 		 466 aa  87.4  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 475 aa  87.4  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  29.26 
 
 		 518 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  29.07 
 
 		 388 aa  87  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 332 aa  86.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 598 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  28.02 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 594 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 775 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  28.4 
 
 		 526 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  29.15 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 692 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  29.46 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  30.87 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 599 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  30.63 
 
 		 632 aa  84  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 585 aa  84  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.41 
 
 		 391 aa  83.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 339 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  26.74 
 
 		 598 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5543  histidine kinase  33.01 
 
 		 637 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.88701  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 334 aa  83.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  26.55 
 
 		 680 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  27.54 
 
 		 1063 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.27 
 
 		 1739 aa  82  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.76 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 771 aa  82.4  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4665  histidine kinase  28.06 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1372  sensor histidine kinase  29.92 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2480  histidine kinase  27.8 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  28.93 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 770 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 553 aa  81.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  28.03 
 
 		 799 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  30.97 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>