More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6490 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 636 aa  1315    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  23.16 
 
 		 795 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  24.51 
 
 		 668 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  23.11 
 
 		 677 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.25 
 
 		 802 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.57 
 
 		 782 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 662 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  40.54 
 
 		 600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6033  histidine kinase  39.27 
 
 		 726 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 662 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  25.71 
 
 		 630 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 		 663 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  37.33 
 
 		 657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5543  histidine kinase  23.42 
 
 		 637 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.88701  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  23.63 
 
 		 715 aa  124  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  25.13 
 
 		 614 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  23.29 
 
 		 631 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.23 
 
 		 660 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  23.7 
 
 		 657 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  25.75 
 
 		 631 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  23.22 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 		 644 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.26 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  24.72 
 
 		 636 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  22.9 
 
 		 707 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.18 
 
 		 867 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  32.24 
 
 		 670 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.35 
 
 		 749 aa  107  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  33.5 
 
 		 738 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  23.3 
 
 		 612 aa  104  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.81 
 
 		 853 aa  104  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.47 
 
 		 683 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  22.42 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  31.47 
 
 		 687 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  21.14 
 
 		 708 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  27.32 
 
 		 631 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  28.17 
 
 		 645 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  32.23 
 
 		 653 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  33.04 
 
 		 518 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  23.54 
 
 		 638 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  31.6 
 
 		 525 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  33.33 
 
 		 592 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.61 
 
 		 726 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 352 aa  97.8  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  28.81 
 
 		 645 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1654  chromosome segregation ATPase; intracellular signalling protein  22.77 
 
 		 596 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  28.24 
 
 		 527 aa  96.3  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 480 aa  95.5  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  22.57 
 
 		 724 aa  95.5  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  30.58 
 
 		 638 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.52 
 
 		 1739 aa  94  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  22.11 
 
 		 1042 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2480  histidine kinase  32.14 
 
 		 350 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3587  Diverse 7TM receptor transmembrane region  21.76 
 
 		 642 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361331  hitchhiker  0.0015887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.76 
 
 		 634 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  29.17 
 
 		 680 aa  92  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 552 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  31.78 
 
 		 392 aa  92  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 		 660 aa  90.9  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  23.13 
 
 		 918 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 421 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 573 aa  90.1  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  29.47 
 
 		 643 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  21.01 
 
 		 650 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  23.33 
 
 		 651 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  28.7 
 
 		 616 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  21.8 
 
 		 914 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1560  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 569 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 461 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 474 aa  89.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 485 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 575 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  29.25 
 
 		 575 aa  88.6  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 658 aa  89  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5475  histidine kinase  29.78 
 
 		 267 aa  89  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 775 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  31.2 
 
 		 497 aa  88.2  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  32.08 
 
 		 1024 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 575 aa  87.8  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  21.04 
 
 		 925 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 443 aa  87  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0719701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  28.69 
 
 		 513 aa  87  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.88 
 
 		 914 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1061  diguanylate cyclase  22.56 
 
 		 632 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  31.93 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  21.87 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 748 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  30.04 
 
 		 632 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 661 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  29.76 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  31.19 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  29.17 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>