More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1988 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 730 aa  1442    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  26.15 
 
 		 643 aa  165  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6033  histidine kinase  23.05 
 
 		 726 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  26.02 
 
 		 638 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  25.17 
 
 		 645 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5914  histidine kinase  34.91 
 
 		 288 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0349357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  29.17 
 
 		 616 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  33.06 
 
 		 670 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  36.19 
 
 		 246 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  23.43 
 
 		 653 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  29.91 
 
 		 270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  28.03 
 
 		 680 aa  114  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  28.77 
 
 		 657 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  24.22 
 
 		 738 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  30.18 
 
 		 645 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  23.78 
 
 		 600 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.69 
 
 		 466 aa  106  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  27.51 
 
 		 687 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  28.91 
 
 		 392 aa  104  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  26.94 
 
 		 592 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  23.49 
 
 		 664 aa  104  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  30.1 
 
 		 525 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27.17 
 
 		 1024 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  25.09 
 
 		 287 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 493 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 480 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 459 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  24.23 
 
 		 460 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 461 aa  98.6  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.29 
 
 		 383 aa  97.8  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 475 aa  98.2  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 459 aa  97.8  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 695 aa  97.4  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  34.43 
 
 		 632 aa  97.8  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 351 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 351 aa  97.4  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  28.51 
 
 		 497 aa  97.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  27.73 
 
 		 526 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5543  histidine kinase  29.38 
 
 		 637 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.88701  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  25.58 
 
 		 673 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  25.99 
 
 		 1063 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 673 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 		 459 aa  95.1  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  25.98 
 
 		 422 aa  95.1  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 339 aa  95.1  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.57 
 
 		 388 aa  95.1  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  24.58 
 
 		 431 aa  94.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 469 aa  94.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 603 aa  94  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 473 aa  94  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  27 
 
 		 1739 aa  94.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  28.38 
 
 		 439 aa  94  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 408 aa  94  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  28.64 
 
 		 447 aa  93.6  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  28.14 
 
 		 404 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  24.81 
 
 		 459 aa  92.8  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4713  histidine kinase  28.14 
 
 		 404 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.739692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 535 aa  93.2  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 748 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  23.63 
 
 		 466 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  29.06 
 
 		 351 aa  92  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.08 
 
 		 373 aa  92.4  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  26.12 
 
 		 493 aa  92  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  27.15 
 
 		 740 aa  92  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0305  histidine kinase  25.12 
 
 		 360 aa  92  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000133295  hitchhiker  0.0003642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  26.96 
 
 		 598 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  26.7 
 
 		 515 aa  91.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 351 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  26.15 
 
 		 783 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 298 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 313 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.11 
 
 		 466 aa  91.3  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 462 aa  91.3  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 462 aa  91.3  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 471 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  26.36 
 
 		 458 aa  90.9  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  30.13 
 
 		 339 aa  90.9  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  23.71 
 
 		 466 aa  90.9  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  23.71 
 
 		 466 aa  90.9  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 570 aa  90.9  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 490 aa  90.9  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 351 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  27.62 
 
 		 379 aa  90.9  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 351 aa  90.9  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 351 aa  90.9  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 351 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 351 aa  90.9  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 471 aa  90.5  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 351 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  28.23 
 
 		 298 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 598 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  28.77 
 
 		 501 aa  89.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  22.87 
 
 		 470 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 359 aa  89.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  27.12 
 
 		 278 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 489 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.748441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  29.33 
 
 		 585 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 485 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>