More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1610 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1610  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
485 aa  959    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.149131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 
459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130271  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  29.63 
 
 
489 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
501 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
468 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
546 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  28.09 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
682 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
490 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
775 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  31.98 
 
 
573 aa  74.3  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
475 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  28.57 
 
 
638 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
638 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 
725 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  26.65 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  25.07 
 
 
466 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1105  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
632 aa  70.1  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.097468  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  26.98 
 
 
783 aa  70.1  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.15 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  32.26 
 
 
710 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  32.26 
 
 
710 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  27.48 
 
 
683 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4345  putative signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
466 aa  67  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.262209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  31.98 
 
 
481 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  29.8 
 
 
797 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
393 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
661 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
472 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
573 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
421 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
546 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3085  putative two component signal transduction protein  31.07 
 
 
467 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 
795 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
424 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
462 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  27.62 
 
 
439 aa  63.9  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
424 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
799 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
795 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  27.85 
 
 
620 aa  63.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 
598 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
459 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  30.29 
 
 
325 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
459 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
795 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
425 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  27.31 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  27.31 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  27.31 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  29.92 
 
 
799 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  29.82 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1670  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.39 
 
 
446 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.31 
 
 
598 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  30.45 
 
 
470 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
795 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  26.22 
 
 
1031 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
564 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
631 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  29.67 
 
 
368 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
348 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.36 
 
 
613 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
456 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.36 
 
 
598 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.36 
 
 
598 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
390 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.36 
 
 
598 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
392 aa  60.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  30.89 
 
 
538 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
417 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
536 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4599  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  27.6 
 
 
637 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  30.47 
 
 
456 aa  60.1  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  27.24 
 
 
622 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
473 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.36 
 
 
598 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  22.73 
 
 
451 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  23.43 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
488 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  27.34 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  26.92 
 
 
413 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  27.02 
 
 
521 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  42.39 
 
 
536 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  28.38 
 
 
347 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
692 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.06 
 
 
598 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
579 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  27.24 
 
 
622 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
466 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 
402 aa  58.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.71 
 
 
594 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>